204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1446 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0574  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.39 
 
 
531 aa  677    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.158943  normal  0.0218676 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0339  hypothetical protein  59.29 
 
 
534 aa  692    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.495442  normal  0.0503197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0249  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  66.04 
 
 
537 aa  770    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.29 
 
 
534 aa  695    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1446  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1129    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0839  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  55.28 
 
 
533 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00734731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1633  hypothetical protein  40.67 
 
 
459 aa  350  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0076  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.64 
 
 
454 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2191  hypothetical protein  30.65 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1534  hypothetical protein  30.37 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3198  hypothetical protein  31.63 
 
 
464 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.77 
 
 
466 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0236  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.42 
 
 
534 aa  186  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.942909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  33.43 
 
 
412 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1028  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.87 
 
 
451 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  29.67 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1848  DsrK protein  27.56 
 
 
549 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.189216  normal  0.170119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0257  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.35 
 
 
542 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2714  hypothetical protein  27.29 
 
 
439 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1606  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.04 
 
 
541 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0302  hypothetical protein  28.61 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.21 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3709  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  26.77 
 
 
439 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2272  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.33 
 
 
536 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1147  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.95 
 
 
539 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63071  normal  0.964876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0872  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.94 
 
 
461 aa  166  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.301742  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1776  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  28.95 
 
 
536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.279132  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0851  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 
493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0038  DsrK protein  27.46 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1267  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.83 
 
 
453 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2312  DsrK protein  26.81 
 
 
550 aa  163  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2192  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  29.6 
 
 
496 aa  163  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1947  DsrK protein  25.9 
 
 
549 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0704  DsrK protein  27.56 
 
 
549 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0050  Fe-S oxidoreductase  26.28 
 
 
500 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00237763  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1958  hypothetical protein  27.87 
 
 
517 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.25 
 
 
445 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0045  DsrK protein  27.39 
 
 
549 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.77 
 
 
438 aa  160  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.742352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0069  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  28.93 
 
 
536 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.481368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0137  DsrK protein  27.52 
 
 
549 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.258854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0451  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.21 
 
 
549 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.961487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2410  hypothetical protein  29.63 
 
 
461 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.688183  normal  0.0784806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.91 
 
 
463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2478  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  27.65 
 
 
507 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.77 
 
 
543 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000185698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0450  reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  26.07 
 
 
547 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0573  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.45 
 
 
460 aa  153  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2255  hypothetical protein  29.15 
 
 
460 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.97 
 
 
453 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  26.97 
 
 
453 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0845  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.46 
 
 
462 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  31.21 
 
 
418 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0648  hmc operon protein 6  29.79 
 
 
462 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1660  Fe-S oxidoreductase  27.79 
 
 
515 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.7 
 
 
416 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.22 
 
 
457 aa  134  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1376  heterodisulfide reductase  27.32 
 
 
420 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0673613  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2146  hypothetical protein  25.55 
 
 
441 aa  123  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.36 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0899  hypothetical protein  23.46 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.37 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1333  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.53 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265785 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.8 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  23.46 
 
 
490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1439  hypothetical protein  23.34 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4179  hypothetical protein  23.88 
 
 
515 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1023  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.67 
 
 
436 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.14 
 
 
431 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0678003 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.79 
 
 
431 aa  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0694601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.68 
 
 
451 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0594  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.38 
 
 
446 aa  103  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  27.96 
 
 
432 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.44 
 
 
411 aa  97.1  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  28.12 
 
 
314 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.22 
 
 
419 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  31.68 
 
 
308 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.74 
 
 
629 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.1 
 
 
439 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.04 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1577  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.71 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1299  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.96 
 
 
419 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  24.71 
 
 
661 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  22.86 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0947  Fe-S oxidoreductase-like protein  23.12 
 
 
400 aa  65.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.118909  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4054  hypothetical protein  24.56 
 
 
632 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363818  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  22.64 
 
 
617 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3299  hypothetical protein  23.63 
 
 
639 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753442  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.47 
 
 
679 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5067  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.67 
 
 
637 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.010013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  23.28 
 
 
720 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  21.78 
 
 
654 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  22.74 
 
 
654 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4000  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.44 
 
 
632 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  22.91 
 
 
720 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.17 
 
 
661 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4040  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.03 
 
 
633 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206546  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
664 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3745  hypothetical protein  22.6 
 
 
633 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0847485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.73 
 
 
661 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>