More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1416 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  44.71 
 
 
1244 aa  1028    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  45 
 
 
1242 aa  1065    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.07 
 
 
1241 aa  1034    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  44.6 
 
 
1241 aa  1041    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  44.07 
 
 
1241 aa  1030    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  43.99 
 
 
1241 aa  1030    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  43.99 
 
 
1241 aa  1027    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  43.97 
 
 
1251 aa  1060    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  43.73 
 
 
1233 aa  994    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.22 
 
 
1241 aa  1031    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  41.77 
 
 
1248 aa  994    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  33.69 
 
 
1377 aa  726    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.15 
 
 
1240 aa  1029    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  44.07 
 
 
1241 aa  1030    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  37.67 
 
 
1282 aa  826    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  44.66 
 
 
1242 aa  1009    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  100 
 
 
1244 aa  2557    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  46.44 
 
 
1230 aa  1053    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  38.92 
 
 
1392 aa  837    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.92 
 
 
1271 aa  946    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  40.78 
 
 
1270 aa  943    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  37.88 
 
 
1236 aa  832    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  43.99 
 
 
1241 aa  1033    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  44.07 
 
 
1241 aa  1030    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  31.77 
 
 
1218 aa  602  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  30.87 
 
 
1217 aa  585  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  30.87 
 
 
1217 aa  585  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.85 
 
 
1230 aa  569  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.9 
 
 
1186 aa  543  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  30.66 
 
 
1204 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  46.26 
 
 
1405 aa  539  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  32.69 
 
 
1392 aa  490  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  32.64 
 
 
1240 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  28.65 
 
 
1121 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.83 
 
 
1203 aa  440  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  29.45 
 
 
1207 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  29.42 
 
 
1217 aa  415  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  27.39 
 
 
1226 aa  214  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 
1149 aa  211  9e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 
1080 aa  207  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 
1184 aa  195  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.09 
 
 
1139 aa  180  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 
1165 aa  169  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  27.67 
 
 
1057 aa  164  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 
1115 aa  159  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  24.32 
 
 
1121 aa  152  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  22.99 
 
 
1047 aa  151  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  24.12 
 
 
1107 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 
1173 aa  149  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  23.94 
 
 
1125 aa  146  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.06 
 
 
1089 aa  144  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 
1130 aa  130  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 
1120 aa  130  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  24.03 
 
 
1177 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 
1185 aa  129  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 
1074 aa  128  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.67 
 
 
1089 aa  125  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 
1196 aa  125  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 
1159 aa  124  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 
1147 aa  124  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 
1123 aa  124  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.42 
 
 
678 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.47 
 
 
1200 aa  121  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 
1061 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  25.75 
 
 
1161 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 
1164 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 
1173 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.31 
 
 
1156 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  23.02 
 
 
638 aa  116  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  25.73 
 
 
1061 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 
1110 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 
1173 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  24.63 
 
 
1187 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 
1202 aa  112  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 
1065 aa  111  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.14 
 
 
1183 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  26.35 
 
 
1165 aa  110  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.31 
 
 
713 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  25 
 
 
1157 aa  110  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  26.19 
 
 
1142 aa  110  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  23.58 
 
 
1161 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.13 
 
 
745 aa  109  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.67 
 
 
1197 aa  109  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  22.86 
 
 
1087 aa  109  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 
1162 aa  108  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 
1131 aa  108  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.48 
 
 
785 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  24.3 
 
 
1166 aa  107  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 
1117 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25 
 
 
1168 aa  107  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  26.58 
 
 
1147 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 
787 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  23.15 
 
 
786 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.96 
 
 
630 aa  106  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  24.49 
 
 
1156 aa  106  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  23.2 
 
 
790 aa  106  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.07 
 
 
732 aa  106  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.52 
 
 
1129 aa  106  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  22.61 
 
 
787 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.29 
 
 
731 aa  105  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0670143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>