More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1373 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1373  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 478 aa  947    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1032  hypothetical protein  54.56 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0999  hypothetical protein  54.14 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0968  amino acid permease-associated region  43.03 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 		 472 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  40.6 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  42.03 
 
 		 473 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 		 473 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 		 475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 		 475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  41.47 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  41.59 
 
 		 473 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  41.47 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  42.26 
 
 		 470 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  39.83 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  40.22 
 
 		 473 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  39.26 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  39.78 
 
 		 473 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  39.52 
 
 		 471 aa  348  8e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  39.83 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  39.56 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  40.22 
 
 		 473 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  40 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  40 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  39.65 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  39.65 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  39.43 
 
 		 474 aa  338  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  39.05 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  39.43 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  39.43 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  39.52 
 
 		 474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  39.22 
 
 		 478 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  39.22 
 
 		 474 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  39.64 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  38.74 
 
 		 466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  39.78 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  38.15 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  39.77 
 
 		 524 aa  318  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  38.46 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  39.26 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  39.05 
 
 		 467 aa  315  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  39.49 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  39.49 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  38.17 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  39.53 
 
 		 472 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  39.04 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  38.72 
 
 		 472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  38.69 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  38.69 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  39.17 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  39.17 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  38.51 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  39.21 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  38.6 
 
 		 469 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  39.21 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  39.21 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  39.21 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  37.33 
 
 		 461 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  37.56 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  39.68 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  39.68 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  39.46 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  39.46 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  39.46 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  39.46 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  38.39 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  38.39 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  38.39 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  39.46 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  38.57 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  38.16 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  38.16 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  38 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  38.16 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  38.16 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  38.16 
 
 		 475 aa  301  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  37.1 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  37.1 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  37.61 
 
 		 471 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  37.1 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  39.46 
 
 		 463 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  37.1 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  37.1 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  37.39 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  35.26 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  35.26 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  35.26 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  35.26 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  35.26 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  35.26 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  38.55 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  36.87 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>