More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1362 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 319 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4017  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.27 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535278  normal  0.0175601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  45.43 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.09 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  45.89 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.22 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  44.27 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  42.32 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  45.43 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  41.69 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  41.69 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2019  cysteine synthase  44.3 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1942  cysteine synthase A  43.99 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  44.2 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  44.51 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  42.54 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  44.97 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.54 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  41.64 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  43.35 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  44.83 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  43.73 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  39.68 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  44.87 
 
 		 320 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1347  cysteine synthase A  40.89 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1605  O-acetylserine (thiol)-lyase  41.46 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02123  cysteine synthase A  43.22 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  40.91 
 
 		 461 aa  225  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6411  cysteine synthase  40.72 
 
 		 312 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  38.91 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  44.84 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  44.23 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  40.96 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  40.71 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  40.19 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  43.99 
 
 		 318 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5540  cysteine synthase  40.72 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816879  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  39.23 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5905  cysteine synthase  40.72 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  40.81 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4742  cysteine synthase A  39.56 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  39.17 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.06 
 
 		 453 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  40.84 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  38.91 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  38.91 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  43.12 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  40.88 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  43.12 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.53 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  39.81 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  39.12 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  41.67 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  38.59 
 
 		 303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  42.59 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  40.97 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  42.81 
 
 		 325 aa  221  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  38.85 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  40.06 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  40.32 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  40.65 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  40.65 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  40.33 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1694  cysteine synthase A  38.92 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  42.63 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  40.33 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  40.65 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  39.74 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  39.74 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  39.74 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  39.74 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  39.74 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  39.74 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  42.24 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  39.74 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  42.68 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  42.31 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  40.45 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  41.93 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2094  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2138  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0499  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.95 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1718  cysteine synthase A  42.07 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.306784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 304 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  39.49 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  39.94 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  39.55 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  38.54 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  39.42 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  43.35 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2901  cysteine synthase  42.04 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  39.38 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  41.59 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  39.87 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  41.4 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4638  cysteine synthase A  39.49 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  40.84 
 
 		 302 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  39.05 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  40 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  41.43 
 
 		 320 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>