More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1333 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  100 
 
 		 466 aa  920    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  46.19 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1337  Na+/solute symporter  37.09 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  34.24 
 
 		 464 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  30.37 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.58 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3539  Na+/solute symporter  25.39 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5962  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  25.96 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3710  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.59 
 
 		 474 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  26.43 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0563  Na+/solute symporter  28.02 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.379209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.86 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1533  Na+/solute symporter  27.66 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6296  Na+/solute symporter  27.66 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957255  normal  0.770519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6955  Na+/solute symporter  27.66 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.269545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.86 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  29.6 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  28.86 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.73 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  29.1 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6434  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 473 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28.19 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  23 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  24.51 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  24.24 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  25.38 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.95 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  27.95 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.94 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8130  Na+/solute symporter  25.64 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25.86 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.62 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.89 
 
 		 463 aa  99.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3294  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 469 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.16 
 
 		 464 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  23.63 
 
 		 471 aa  96.7  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  25.42 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.03 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 486 aa  94  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  25.31 
 
 		 479 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1298  Na+/solute symporter  25.44 
 
 		 472 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  22.84 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 		 551 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.6 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  23.52 
 
 		 495 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.17 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  22.29 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0154  Na+/solute symporter  23.32 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.535073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  20.6 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.65 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  20.62 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.75 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.02 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  20.6 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  22.27 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.11 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.92 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  26.12 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  25.66 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.47 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  29.18 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  22.62 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  29.18 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  29.18 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.56 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  23.78 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.88 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  24.94 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  22.52 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.6 
 
 		 520 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.31 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  26.59 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  27.07 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.08 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.97 
 
 		 548 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  23.67 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.44 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  22.59 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  21.38 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  25.27 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  23.08 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  23.99 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  23.99 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.92 
 
 		 520 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  23.99 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  23.56 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  21.99 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  23.09 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>