More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1258 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.66 
 
 
411 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.48 
 
 
167 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  54.03 
 
 
186 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  53.23 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  53.23 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  53.23 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  53.23 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  54.03 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.11 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  53.23 
 
 
186 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  51.11 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0304  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.22 
 
 
168 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  53.23 
 
 
186 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  52.42 
 
 
186 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.37 
 
 
253 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  50.37 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.61 
 
 
186 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  49.63 
 
 
253 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.63 
 
 
253 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.15 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2845  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.22 
 
 
169 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.93 
 
 
153 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3616  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.74 
 
 
156 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4899  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5274  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5143  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4743  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4762  hypothetical protein  44.27 
 
 
153 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0806  hypothetical protein  53.64 
 
 
219 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5187  hypothetical protein  43.7 
 
 
153 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5172  hypothetical protein  43.51 
 
 
153 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5178  hypothetical protein  43.7 
 
 
153 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.87 
 
 
289 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.38 
 
 
255 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.59 
 
 
266 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.96 
 
 
332 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.54 
 
 
192 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.13 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.09 
 
 
205 aa  99  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
112 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.86 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.97 
 
 
415 aa  95.5  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.43 
 
 
263 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 
349 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.04 
 
 
175 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.98 
 
 
382 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.22 
 
 
115 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.71 
 
 
219 aa  89  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.8 
 
 
206 aa  89  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.2 
 
 
217 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.83 
 
 
315 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.21 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 
204 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4081  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.84 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.1 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.62 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2026  hypothetical protein  36.02 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.34 
 
 
165 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.66 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1637  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.86 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000221895  hitchhiker  0.00347843 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1457  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG protein family protein  33.86 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000050747  normal  0.073975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3988  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.13 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.35 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.5 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.62 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.85 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1784  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.09 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.909249  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.66 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.66 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0927  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.43 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000328138  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.34 
 
 
181 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.88 
 
 
172 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1255  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.48 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0180405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.78 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18821  hypothetical protein  32.89 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.491135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0210  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.74 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.521298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG like protein  37.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0060  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.03 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5216  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.39 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.84 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2687  hypothetical protein  30.32 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2959  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 
168 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0294262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.43 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.82 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0772  hypothetical protein  36.72 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.8508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  35.48 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1586  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.35 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2161  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.17 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0183  putative lipoprotein  40.43 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.52 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0331  hypothetical protein  36.15 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0961957  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3518  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.18 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.886237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0573  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.17 
 
 
441 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>