More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1198 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  100 
 
 		 454 aa  931    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  64.54 
 
 		 457 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  53.1 
 
 		 449 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  52 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  52 
 
 		 453 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  51.99 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  51.99 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  53.11 
 
 		 448 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  53.86 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  52 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  50.78 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  41.14 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  43.98 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  43.98 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  43.76 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  43.76 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  43.54 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  42.93 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  35.02 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  41.94 
 
 		 295 aa  186  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1173  hypothetical protein  46.86 
 
 		 189 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00228603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  25.18 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.32 
 
 		 1102 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 1028 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6303  helicase domain protein  24.33 
 
 		 493 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.68 
 
 		 1110 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.37 
 
 		 1082 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  24.84 
 
 		 809 aa  94  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 		 918 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  25.43 
 
 		 964 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  25.48 
 
 		 918 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  23.27 
 
 		 1021 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  25.16 
 
 		 918 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  25.16 
 
 		 918 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  27.13 
 
 		 1084 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  25.16 
 
 		 918 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  24.95 
 
 		 918 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  25.16 
 
 		 918 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  25.16 
 
 		 918 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  24.95 
 
 		 918 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  25.27 
 
 		 674 aa  90.1  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  27.51 
 
 		 1081 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  26.7 
 
 		 1084 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  26.48 
 
 		 991 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  26.03 
 
 		 572 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  27.29 
 
 		 726 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  25 
 
 		 1127 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 		 982 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  23.82 
 
 		 918 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  24.84 
 
 		 918 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  23.9 
 
 		 1068 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  26.13 
 
 		 985 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 1449 aa  87  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  24.77 
 
 		 1163 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1739  SNF2-related protein  24.84 
 
 		 375 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0287077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  25.51 
 
 		 1284 aa  86.3  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.54 
 
 		 1118 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  25.85 
 
 		 1159 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 		 933 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.35 
 
 		 977 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 		 1068 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  23.8 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 		 1066 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  25.22 
 
 		 1381 aa  84  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.54 
 
 		 925 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 		 1112 aa  84  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  24.95 
 
 		 924 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 1082 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.65 
 
 		 1227 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 1074 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  24.37 
 
 		 1112 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  25.83 
 
 		 1064 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 		 1091 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.08 
 
 		 641 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  22.27 
 
 		 1068 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  24.44 
 
 		 906 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  23.04 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 1129 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  25.58 
 
 		 1209 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 1403 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  22.65 
 
 		 1055 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  23.44 
 
 		 1077 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  25.26 
 
 		 1025 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  22.48 
 
 		 1071 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  24.4 
 
 		 1154 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  26.22 
 
 		 1069 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  24.94 
 
 		 1064 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.47 
 
 		 1069 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  21.96 
 
 		 545 aa  77.4  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  23.89 
 
 		 1108 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  26.28 
 
 		 1084 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 		 1102 aa  77  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  24.6 
 
 		 1064 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  24.43 
 
 		 1064 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 		 1068 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  24.35 
 
 		 1091 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  25.96 
 
 		 1096 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  23.94 
 
 		 1250 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  23.97 
 
 		 1072 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>