15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1188 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1188  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  819    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000178859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3066  hypothetical protein  56.51 
 
 
411 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1037  hypothetical protein  47.14 
 
 
388 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1056  hypothetical protein  47.14 
 
 
388 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1232  hypothetical protein  49.1 
 
 
375 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000219074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2859  hypothetical protein  49.61 
 
 
378 aa  333  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000759798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1102  hypothetical protein  46.63 
 
 
379 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000164334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0375  hypothetical protein  47.41 
 
 
362 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1471  hypothetical protein  42.34 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1409  hypothetical protein  41.25 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1208  hypothetical protein  33.26 
 
 
436 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1203  hypothetical protein  28.95 
 
 
425 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1823  hypothetical protein  29.19 
 
 
425 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1179  hypothetical protein  29.67 
 
 
425 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3416  hypothetical protein  26.72 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.46551  hitchhiker  0.00552362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>