More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1161 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  56.25 
 
 
200 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  46.15 
 
 
198 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  45.08 
 
 
198 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  42.86 
 
 
197 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  43.37 
 
 
197 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.39 
 
 
194 aa  150  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  43.37 
 
 
197 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  42.93 
 
 
219 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  44.15 
 
 
195 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  41.49 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  42.13 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  45.3 
 
 
200 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  47.03 
 
 
194 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  43.41 
 
 
194 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  45.95 
 
 
192 aa  143  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  42.78 
 
 
198 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  40.87 
 
 
217 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  40.87 
 
 
217 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  40.89 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  42.35 
 
 
198 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.21 
 
 
198 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  42.64 
 
 
205 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  41.63 
 
 
226 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
198 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.4 
 
 
200 aa  138  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
198 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  42.35 
 
 
198 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
198 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.58 
 
 
215 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.8 
 
 
198 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  41.06 
 
 
226 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  44.2 
 
 
203 aa  134  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  39.27 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  40.86 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  39.79 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.41 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  42.71 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  43.59 
 
 
222 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  45.2 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.57 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  42.55 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  40 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.36 
 
 
197 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  42.19 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  41.54 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.62 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  40.86 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.1 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  38.89 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.67 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  40 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.51 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  38.89 
 
 
220 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  40.21 
 
 
201 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  39.57 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  36.36 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  44.83 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  36.54 
 
 
216 aa  124  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  41.58 
 
 
210 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  39.23 
 
 
205 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  36.54 
 
 
216 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.66 
 
 
197 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.45 
 
 
199 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  39.04 
 
 
196 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.24 
 
 
205 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.6 
 
 
201 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  34.85 
 
 
209 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3520  hypothetical protein  40.67 
 
 
225 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.390146  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  36.87 
 
 
215 aa  121  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.02 
 
 
231 aa  121  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  37.89 
 
 
200 aa  121  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  37.44 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  38.73 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  38.58 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  39.89 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  39.69 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  38.73 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  38.95 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  33.49 
 
 
212 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.7 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  42.7 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  42.57 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  34.21 
 
 
235 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  39.05 
 
 
217 aa  118  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1023  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.81 
 
 
219 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0416412  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  39.52 
 
 
214 aa  117  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  38.92 
 
 
202 aa  117  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  38.22 
 
 
195 aa  117  9e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  41.75 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2815  protein of unknown function DUF205  43.17 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  42.63 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.59 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.15 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>