93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1140 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1140  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2093  nucleoside recognition domain protein  78.46 
 
 		 197 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.752019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1198  nucleoside recognition domain-containing protein  71.28 
 
 		 199 aa  290  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.499507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1296  nucleoside recognition domain protein  66.67 
 
 		 194 aa  268  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1356  nucleoside recognition  58.67 
 
 		 201 aa  230  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3415  nucleoside recognition domain protein  57.51 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1413  nucleoside recognition proteinn  57.14 
 
 		 197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.045415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1647  nucleoside recognition domain protein  49.74 
 
 		 191 aa  205  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0165  nucleoside recognition domain protein  48.45 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000554794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2099  nucleoside recognition  48.72 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000373949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1732  nucleoside recognition domain protein  49.74 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1563  spore maturation protein A  53.76 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000258418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1595  spore maturation protein A  53.76 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3820  spore maturation protein A  54.3 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000109471 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1491  spore maturation protein A  53.76 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1380  spore maturation protein A  53.76 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1525  spore maturation protein A  54.3 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1353  spore maturation protein A  53.76 
 
 		 198 aa  197  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1352  spore maturation protein A  53.76 
 
 		 198 aa  197  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.250513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1631  spore maturation protein A  53.76 
 
 		 198 aa  197  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1393  nucleoside recognition domain-containing protein  53.76 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1194  nucleoside recognition domain-containing protein  53.23 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2225  nucleoside recognition domain protein  50 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000271237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0396  nucleoside recognition domain protein  50.54 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11850  nucleoside recognition domain protein  45.5 
 
 		 194 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0063  nucleoside recognition domain-containing protein  45.55 
 
 		 194 aa  184  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000780152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0705  nucleoside recognition domain protein  47.94 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0608  hypothetical protein  46.67 
 
 		 201 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0625  hypothetical protein  46.67 
 
 		 201 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1273  nucleoside recognition domain-containing protein  43.56 
 
 		 432 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.944604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0509  nucleoside recognition domain protein  44.06 
 
 		 459 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0347  nucleoside recognition domain-containing protein  48.52 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398267  normal  0.263766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2909  nucleoside recognition  43.39 
 
 		 437 aa  165  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0621588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0157  nucleoside recognition domain-containing protein  44.62 
 
 		 427 aa  161  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1060  nucleoside recognition domain-containing protein  48.78 
 
 		 440 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4200  nucleoside recognition domain protein  49.47 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.670232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4076  nucleoside recognition  48.55 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850032  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0511  spore maturation protein A/spore maturation protein B  39.79 
 
 		 410 aa  154  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  43.15 
 
 		 419 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2857  spore maturation protein A  39.58 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4225  nucleoside recognition domain protein  48.94 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3908  spore maturation protein  38.14 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2542  spore maturation protein A  39.06 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3256  nucleoside recognition  47.2 
 
 		 414 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3903  nucleoside recognition domain protein  41.44 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1045  hypothetical protein  40.4 
 
 		 412 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3198  nucleoside recognition  45.34 
 
 		 414 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000170625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2454  nucleoside recognition domain-containing protein  41.12 
 
 		 408 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1897  nucleoside recognition domain protein  41.12 
 
 		 408 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3988  nucleoside recognition domain protein  40.33 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000391988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2447  nucleoside recognition domain-containing protein  40.61 
 
 		 408 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2209  nucleoside recognition domain-containing protein  39.09 
 
 		 408 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.609992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2567  nucleoside recognition domain-containing protein  41.12 
 
 		 408 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.154533  normal  0.0459747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0012  nucleoside recognition domain-containing protein  38.76 
 
 		 417 aa  141  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.972428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0030  nucleoside recognition domain protein  38.76 
 
 		 417 aa  141  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2643  nucleoside recognition domain-containing protein  37.56 
 
 		 408 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0603186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4460  nucleoside recognition domain protein  39.27 
 
 		 411 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1987  nucleoside recognition domain-containing protein  39.09 
 
 		 408 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3694  nucleoside recognition domain-containing protein  46.58 
 
 		 419 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1666  nucleoside recognition domain-containing protein  38.58 
 
 		 408 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3506  nucleoside recognition domain-containing protein  40.31 
 
 		 409 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.848291  normal  0.806828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1741  nucleoside recognition domain-containing protein  38.58 
 
 		 408 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3343  nucleoside recognition  43.12 
 
 		 414 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000052654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1771  nucleoside recognition domain-containing protein  38.07 
 
 		 408 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.253626  normal  0.260511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2867  nucleoside recognition domain protein  41.62 
 
 		 411 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0752629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2607  spore maturation protein A-related protein  38.69 
 
 		 408 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1928  nucleoside recognition domain-containing protein  36.55 
 
 		 408 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269289  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0342  nucleoside recognition domain protein  43.12 
 
 		 415 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.615093  normal  0.386268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0327  nucleoside recognition domain protein  43.12 
 
 		 415 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1584  nucleoside recognition domain-containing protein  37.57 
 
 		 408 aa  134  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.407831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0141  nucleoside recognition domain protein  40.5 
 
 		 409 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.375591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1253  nucleoside recognition domain protein  46.29 
 
 		 333 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0026  nucleoside recognition domain-containing protein  37.24 
 
 		 417 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2038  spore maturation protein A-related protein  38.38 
 
 		 408 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0154  nucleoside recognition domain-containing protein  38.89 
 
 		 409 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0452  putative transmembrane protein  42.5 
 
 		 415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5089  nucleoside recognition domain-containing protein  38.38 
 
 		 409 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.394675  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0138  nucleoside recognition domain protein  37.88 
 
 		 409 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.684841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0156  nucleoside recognition domain-containing protein  37.88 
 
 		 409 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2590  nucleoside recognition domain protein  43.92 
 
 		 423 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204339  normal  0.0892212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0041  nucleoside recognition  37.88 
 
 		 409 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.672164  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0066  bifunctional spore maturation protein, fused SpmA/SpmB  37.88 
 
 		 413 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0121  hypothetical protein  37.37 
 
 		 413 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0719  putative spore maturation protein A/B  36.51 
 
 		 409 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00390  hypothetical protein  38.22 
 
 		 409 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2045  nucleoside recognition  36.55 
 
 		 412 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2235  nucleoside recognition domain-containing protein  37.78 
 
 		 412 aa  121  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2584  nucleoside recognition domain protein  34.38 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0491537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6276  hypothetical protein  37.88 
 
 		 409 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72320  hypothetical protein  37.88 
 
 		 409 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0078  nucleoside recognition domain-containing protein  39.9 
 
 		 409 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0879  nucleoside recognition domain-containing protein  40.14 
 
 		 479 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2165  spore maturation-related protein  37.86 
 
 		 476 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>