More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1084 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 565 aa  1147    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  44.39 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  45.83 
 
 		 572 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  43.13 
 
 		 567 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  42.76 
 
 		 570 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 577 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  40.64 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.72 
 
 		 573 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  42.58 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  40.75 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  41.01 
 
 		 554 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 		 579 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 		 579 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 		 579 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  38.11 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  38.11 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  38.11 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  38.68 
 
 		 566 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  37.94 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  39.79 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  38.99 
 
 		 579 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  41.89 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 		 580 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 599 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  38.89 
 
 		 560 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 558 aa  369  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  40.71 
 
 		 560 aa  364  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  38.01 
 
 		 556 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  37.04 
 
 		 555 aa  360  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 572 aa  359  8e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  37.03 
 
 		 565 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  36.67 
 
 		 562 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 		 553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  36.85 
 
 		 565 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 		 574 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 587 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 561 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 588 aa  349  8e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  40.64 
 
 		 551 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  36.46 
 
 		 555 aa  348  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 560 aa  347  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  37.1 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  36.24 
 
 		 588 aa  343  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  36.24 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.84 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 582 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 		 575 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 		 559 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 567 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 561 aa  329  8e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 		 574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 		 578 aa  326  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 586 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 		 552 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  35 
 
 		 556 aa  323  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  34.1 
 
 		 570 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 586 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 551 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 569 aa  321  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 558 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.11 
 
 		 605 aa  319  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  35.98 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 558 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 572 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 		 611 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 569 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  34.31 
 
 		 589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 557 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 557 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.75 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  33.45 
 
 		 551 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.03 
 
 		 553 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 		 568 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  35.94 
 
 		 568 aa  309  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 606 aa  309  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 557 aa  309  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.81 
 
 		 608 aa  309  9e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 556 aa  309  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  34.58 
 
 		 564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>