12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1053 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1053  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  276  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000068634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2692  hypothetical protein  58.59 
 
 
152 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1006  hypothetical protein  46.38 
 
 
140 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0547  hypothetical protein  37.14 
 
 
144 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1537  hypothetical protein  44.29 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.10906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2127  hypothetical protein  42.31 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000133083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1921  hypothetical protein  35.59 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.745718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1524  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1687  hypothetical protein  46.38 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0846  hypothetical protein  36.21 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000381443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1716  hypothetical protein  31.58 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0515781 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1041  hypothetical protein  25.95 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000875805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>