More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1052 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  70.65 
 
 		 185 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  63.78 
 
 		 185 aa  265  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  64.13 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  63.04 
 
 		 185 aa  254  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  61.96 
 
 		 185 aa  253  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  56.22 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  58.92 
 
 		 185 aa  237  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  57.84 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  56.22 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  55.68 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  56.22 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  56.52 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  58.15 
 
 		 185 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  57.61 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  57.61 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  54.59 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  55.14 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  52.43 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  54.89 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  54.89 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  54.89 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  51.37 
 
 		 189 aa  213  9e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  52.72 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  52.72 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  50.54 
 
 		 185 aa  211  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  52.46 
 
 		 189 aa  208  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  54.59 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  51.63 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  51.63 
 
 		 190 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  52.97 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  52.97 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  51.63 
 
 		 190 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  51.09 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  50.54 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  51.91 
 
 		 189 aa  201  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  49.46 
 
 		 187 aa  200  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  51.09 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  51.89 
 
 		 188 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  48.37 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  47.28 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  48.91 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  51.61 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  52.46 
 
 		 188 aa  197  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  47.83 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  49.19 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  51.08 
 
 		 190 aa  195  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  49.19 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  47.57 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  50 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  49.73 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  47.83 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  48.37 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  49.18 
 
 		 189 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  48.65 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  47.28 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  49.45 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  50.55 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  51.34 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  50.55 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  46.2 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  45.11 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  49.45 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  51.09 
 
 		 191 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 187 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  47.28 
 
 		 216 aa  190  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  50.82 
 
 		 187 aa  190  9e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  49.45 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  45.65 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  51.61 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  48.35 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  50.54 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  46.7 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>