More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1051 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  100 
 
 
357 aa  733    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  53.24 
 
 
357 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  52.94 
 
 
353 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  50.42 
 
 
356 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  51.96 
 
 
353 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  51.96 
 
 
353 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  51.96 
 
 
353 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  52.23 
 
 
353 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  51.96 
 
 
353 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  51.96 
 
 
353 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  51.68 
 
 
353 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  51.96 
 
 
353 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  52.09 
 
 
353 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  52.12 
 
 
357 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  51.96 
 
 
353 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  50.14 
 
 
353 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  50.7 
 
 
353 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  50.28 
 
 
359 aa  348  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  49.86 
 
 
354 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  46.89 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  46.22 
 
 
356 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  45.22 
 
 
356 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  45.22 
 
 
356 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  45.22 
 
 
356 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  45.38 
 
 
356 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  46.07 
 
 
359 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  45.38 
 
 
356 aa  329  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  45.66 
 
 
356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  45.94 
 
 
356 aa  328  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  45.1 
 
 
356 aa  326  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  48.73 
 
 
357 aa  325  6e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  48.13 
 
 
348 aa  323  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  44.38 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  44.38 
 
 
353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  47.29 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  45.63 
 
 
352 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  49.72 
 
 
361 aa  309  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  46.8 
 
 
353 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  42.02 
 
 
361 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  46.8 
 
 
347 aa  292  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  43.98 
 
 
356 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  44.08 
 
 
353 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  42.02 
 
 
361 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  43.35 
 
 
353 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  42.02 
 
 
361 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  42.02 
 
 
361 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  41.74 
 
 
361 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  41.93 
 
 
363 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  41.74 
 
 
361 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  41.74 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  43.27 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  42.86 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  40.9 
 
 
361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  44.04 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  41.18 
 
 
361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  45.11 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  43.75 
 
 
362 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  44.03 
 
 
362 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  44.63 
 
 
364 aa  278  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  39.83 
 
 
360 aa  278  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  42.44 
 
 
357 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  39.44 
 
 
359 aa  276  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  39.72 
 
 
359 aa  275  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  42.3 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  41.76 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  43.79 
 
 
355 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  45.87 
 
 
356 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  43.18 
 
 
359 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  44.12 
 
 
355 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  44.13 
 
 
354 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  40.9 
 
 
364 aa  263  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  42.98 
 
 
372 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  37.25 
 
 
355 aa  259  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  40.4 
 
 
356 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  42.66 
 
 
357 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  43.23 
 
 
376 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  41.52 
 
 
354 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  41.71 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  44.35 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  39.94 
 
 
355 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  40.23 
 
 
366 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  37.5 
 
 
358 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  38.89 
 
 
381 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  43.63 
 
 
352 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  43.92 
 
 
379 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  41.95 
 
 
359 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  39.24 
 
 
357 aa  247  2e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  43.59 
 
 
363 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  43.02 
 
 
363 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  41.99 
 
 
365 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  38.57 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0065  peptidase M24  41.88 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  39.77 
 
 
371 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  42.9 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  37.14 
 
 
356 aa  239  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  40.43 
 
 
393 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  35.89 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  35.9 
 
 
356 aa  233  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  37.22 
 
 
358 aa  232  7.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2398  peptidase M24  42.44 
 
 
373 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.701554  normal  0.365978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>