63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1006 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 219 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.69 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  50.94 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  50.71 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  49.54 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  45.25 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  44.34 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  45 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  46.58 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  43.95 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.07 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  44.6 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  45.36 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.24 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  44.74 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  40.55 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  41.55 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  40.69 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.75 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  39.71 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.21 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  38.57 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  34.12 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.62 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.93 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.15 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  33.65 
 
 		 206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  36.22 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.02 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.59 
 
 		 212 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  35.94 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  36.18 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.11 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.53 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  35.78 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.29 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  32.8 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  34 
 
 		 553 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  31.58 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  29.47 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  29.47 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.58 
 
 		 544 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.43 
 
 		 570 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.68 
 
 		 598 aa  88.6  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  33.67 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  30.65 
 
 		 545 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  28.37 
 
 		 594 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  28.79 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.31 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.02 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  27.75 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  27.75 
 
 		 580 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.66 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.38 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.14 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  24.45 
 
 		 558 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  23.68 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.12 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 		 525 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  19.69 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.47 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  23.02 
 
 		 202 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  23.71 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>