More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0924 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  39.73 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  38.14 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  37.67 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  40.71 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  35.12 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  40 
 
 		 370 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3916  integrase family protein  33.77 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254607  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  31.52 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  32.99 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  31.1 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0863  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  36.14 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  32.52 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  32.67 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.23 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.77 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  29.81 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  31.14 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.94 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  30.5 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.2 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.41 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  32.33 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  28.01 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  27.6 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.42 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  29.06 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  28 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.7 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.7 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.53 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.7 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  29.24 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.7 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  31.37 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  29.09 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  32.11 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  29.96 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  29.81 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  28.88 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.2 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.98 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  27.4 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.98 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.33 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.73 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.14 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.19 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  30.04 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.54 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.68 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.01 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.7 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.98 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.06 
 
 		 330 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.72 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  30.85 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000863146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.18 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  32 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  31.46 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.18 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 333 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.98 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.04 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.37 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  28.78 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>