207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0916 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  231  2e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 
139 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 
111 aa  80.1  8e-15  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  52.86 
 
 
104 aa  75.9  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.21 
 
 
152 aa  73.9  7e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
137 aa  72.4  2e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  45.31 
 
 
114 aa  69.7  1e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  42.68 
 
 
117 aa  69.3  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  44.29 
 
 
301 aa  67.8  4e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
142 aa  67.4  6e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  41.56 
 
 
145 aa  67.4  6e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
231 aa  67  8e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
123 aa  67  9e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 
100 aa  66.2  1e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  35.78 
 
 
125 aa  66.2  1e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 
124 aa  63.9  7e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
143 aa  63.2  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 
206 aa  62  3e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  61.2  4e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  61.2  4e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 
78 aa  60.8  6e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 
151 aa  60.8  6e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
82 aa  60.8  6e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
127 aa  60.1  1e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
137 aa  59.7  1e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 
114 aa  59.7  1e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
75 aa  59.3  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
75 aa  59.3  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  44.44 
 
 
117 aa  59.3  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
206 aa  58.9  2e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
75 aa  59.3  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
281 aa  58.9  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.86405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  45.59 
 
 
113 aa  58.9  2e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.71645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 
163 aa  58.9  2e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  45.59 
 
 
113 aa  58.9  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.03 
 
 
142 aa  57.8  5e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
321 aa  56.2  1e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
152 aa  56.2  1e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 
334 aa  55.8  2e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  7.90722e-13 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  42.42 
 
 
139 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
142 aa  54.3  5e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  42.86 
 
 
117 aa  54.3  6e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
72 aa  54.3  6e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.47 
 
 
206 aa  53.5  9e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  39.68 
 
 
116 aa  53.5  9e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  31.19 
 
 
115 aa  53.5  9e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  41.27 
 
 
200 aa  53.1  1e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 
364 aa  52.8  1e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
132 aa  53.1  1e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
110 aa  52.4  2e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
264 aa  52.4  2e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.01655e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 
133 aa  52  3e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 
111 aa  52  3e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 
262 aa  51.2  4e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
128 aa  51.6  4e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
262 aa  51.2  5e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 
262 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 
133 aa  50.8  6e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 
262 aa  50.8  6e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
135 aa  50.4  7e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
244 aa  50.4  8e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 
200 aa  50.4  8e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
312 aa  50.1  9e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 
117 aa  50.1  9e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
128 aa  50.4  9e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72654e-05  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  27.27 
 
 
135 aa  49.7  1e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 
110 aa  48.9  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 
117 aa  48.9  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 
101 aa  48.9  2e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  27.83 
 
 
110 aa  48.9  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 
369 aa  48.9  2e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 
74 aa  49.3  2e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
211 aa  48.5  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
370 aa  48.9  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  29.52 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  28.45 
 
 
125 aa  48.5  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.7 
 
 
144 aa  48.9  3e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 
118 aa  47.8  5e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  45.45 
 
 
149 aa  47.4  6e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  40.32 
 
 
362 aa  47.4  6e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
322 aa  47.4  6e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 
125 aa  47  8e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 
125 aa  47  8e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 
125 aa  47  8e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 
125 aa  47.4  8e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
134 aa  47  8e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.94 
 
 
92 aa  47  8e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  37.5 
 
 
125 aa  47  8e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 
125 aa  47.4  8e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  37.5 
 
 
125 aa  47.4  8e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
67 aa  47  8e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  37.5 
 
 
125 aa  47.4  8e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.94 
 
 
149 aa  47  9e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
125 aa  47  9e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  39.06 
 
 
139 aa  47  9e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
273 aa  47  9e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0223  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  43.94 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.16919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.14379e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>