More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0898 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
586 aa  1203    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  39.33 
 
 
524 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  38.39 
 
 
535 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  31.79 
 
 
498 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 
542 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 
542 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.26 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.32 
 
 
546 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  30.67 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.07 
 
 
665 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.32 
 
 
487 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.24 
 
 
613 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 
521 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.34 
 
 
485 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.12 
 
 
550 aa  120  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  29.78 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  25.17 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  27.67 
 
 
475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.39 
 
 
539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.68 
 
 
522 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.74 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.55 
 
 
515 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.11 
 
 
462 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  24.71 
 
 
500 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  25.93 
 
 
612 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.63 
 
 
523 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  30.96 
 
 
511 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.39 
 
 
541 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.95 
 
 
546 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  28.7 
 
 
518 aa  104  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  25.38 
 
 
522 aa  104  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  24.2 
 
 
504 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.74 
 
 
551 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.59 
 
 
488 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.03 
 
 
415 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
526 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.19 
 
 
516 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.37 
 
 
547 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 
522 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  26.42 
 
 
552 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25 
 
 
516 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.87 
 
 
484 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.95 
 
 
475 aa  101  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  25.93 
 
 
543 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.54 
 
 
506 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  28.01 
 
 
501 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.79 
 
 
523 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.6 
 
 
484 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  27.21 
 
 
474 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 
519 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.48 
 
 
522 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.4 
 
 
540 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.88 
 
 
442 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  24.06 
 
 
522 aa  97.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.31 
 
 
525 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  27.91 
 
 
431 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.39 
 
 
441 aa  97.1  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  24.89 
 
 
532 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 
441 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.85 
 
 
525 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  24.86 
 
 
554 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.15 
 
 
519 aa  94  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  27.69 
 
 
523 aa  94.4  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.67 
 
 
527 aa  93.6  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.3 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.61 
 
 
537 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  24.6 
 
 
517 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  27.73 
 
 
552 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 
554 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.75 
 
 
520 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  23.73 
 
 
537 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 
542 aa  91.3  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.23 
 
 
494 aa  90.9  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  25.29 
 
 
543 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.91 
 
 
525 aa  90.5  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  27.06 
 
 
535 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.83 
 
 
510 aa  89  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  25.29 
 
 
543 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  24.3 
 
 
505 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.92 
 
 
521 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.05 
 
 
544 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.26 
 
 
553 aa  87.8  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.93 
 
 
506 aa  87.4  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  25.59 
 
 
743 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.46 
 
 
504 aa  87.4  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 
449 aa  87  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 
449 aa  87  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  24.1 
 
 
562 aa  87  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 
517 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.01 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.55 
 
 
540 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  24.63 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.03 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  23.96 
 
 
484 aa  85.5  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  24.27 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  24.06 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 
580 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>