More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0757 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
598 aa  645  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 
595 aa  764  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
600 aa  644  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
600 aa  645  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
600 aa  645  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  61.46 
 
 
593 aa  763  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1239  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
598 aa  647  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
591 aa  644  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
601 aa  639  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  61.05 
 
 
593 aa  764  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.00775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
623 aa  654  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 
588 aa  707  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.35097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
591 aa  635  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 
589 aa  670  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.43263e-05  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  64.54 
 
 
594 aa  790  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.73748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
591 aa  646  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
600 aa  645  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
599 aa  635  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 
586 aa  761  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.70105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
600 aa  639  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  61.56 
 
 
590 aa  757  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 
591 aa  651  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 
597 aa  769  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
600 aa  637  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 
613 aa  728  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
602 aa  693  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 
607 aa  679  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  71.24 
 
 
608 aa  905  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.16393e-05  hitchhiker  1.31011e-08 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
600 aa  697  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 
594 aa  760  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.45437e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
598 aa  712  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 
610 aa  706  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
600 aa  645  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
617 aa  670  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 
588 aa  707  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.19088e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
590 aa  635  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 
594 aa  746  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
591 aa  770  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
600 aa  639  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
591 aa  770  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.43649e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
600 aa  639  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
614 aa  701  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
597 aa  639  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
599 aa  649  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
623 aa  654  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 
585 aa  765  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 
602 aa  700  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 
598 aa  775  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.05655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
591 aa  770  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
594 aa  643  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 
593 aa  758  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.05553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 
591 aa  774  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.91465e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
592 aa  652  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
598 aa  637  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 
601 aa  814  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 
589 aa  776  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
592 aa  664  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
598 aa  637  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 
590 aa  770  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.46901e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
593 aa  758  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
589 aa  657  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.7207e-05  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
593 aa  639  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 
597 aa  732  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.45499e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
627 aa  733  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 
588 aa  696  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  9.2939e-06  unclonable  3.39544e-08 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 
598 aa  761  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 
592 aa  781  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.9189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
600 aa  643  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
598 aa  637  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 
591 aa  763  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 
592 aa  759  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
599 aa  665  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
592 aa  673  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  3.66729e-06 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
583 aa  635  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
605 aa  651  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
600 aa  636  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
599 aa  681  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
591 aa  772  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
591 aa  770  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
603 aa  656  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 
588 aa  716  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 
595 aa  660  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  53 
 
 
602 aa  642  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
599 aa  650  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
592 aa  669  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  60.89 
 
 
594 aa  746  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12068e-12  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 
600 aa  796  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
588 aa  661  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
600 aa  644  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 
591 aa  772  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.582e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
591 aa  649  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
606 aa  727  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
594 aa  642  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.46052e-09  decreased coverage  2.30652e-07 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
594 aa  674  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  3.93733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 
591 aa  773  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
598 aa  645  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
591 aa  769  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
596 aa  655  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  6.26629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 
597 aa  733  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>