225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0740 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 
406 aa  846    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  64.92 
 
 
422 aa  512  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  60.56 
 
 
416 aa  505  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.21 
 
 
423 aa  496  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  57.83 
 
 
416 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  62.47 
 
 
427 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.49 
 
 
472 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  59.49 
 
 
473 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  59.24 
 
 
473 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.99 
 
 
472 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.63 
 
 
436 aa  482  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  55.83 
 
 
420 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  59.3 
 
 
420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  61.69 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.24 
 
 
437 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.14 
 
 
437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  54.29 
 
 
414 aa  441  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  56.91 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.5 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.25 
 
 
440 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.67 
 
 
437 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  51.75 
 
 
483 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  57.42 
 
 
453 aa  432  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  55.07 
 
 
433 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.79 
 
 
433 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  56.11 
 
 
457 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  57.1 
 
 
454 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  54.32 
 
 
435 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.68 
 
 
433 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  54.17 
 
 
730 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  56.11 
 
 
730 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  53.89 
 
 
708 aa  423  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.83 
 
 
413 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.12 
 
 
440 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.83 
 
 
433 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  54.02 
 
 
437 aa  420  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  53.12 
 
 
375 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.12 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.84 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.99 
 
 
403 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.87 
 
 
454 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  49.33 
 
 
439 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.23 
 
 
413 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  47.95 
 
 
439 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  50.42 
 
 
439 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.45 
 
 
419 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.1 
 
 
427 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  48.48 
 
 
415 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.19 
 
 
460 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.4 
 
 
432 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.44 
 
 
407 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  48.26 
 
 
527 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  45.28 
 
 
412 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.62 
 
 
419 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  47.41 
 
 
422 aa  366  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.16 
 
 
396 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.92 
 
 
422 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.01 
 
 
374 aa  359  5e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.44 
 
 
381 aa  358  7e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.92 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.4 
 
 
365 aa  355  8.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.79 
 
 
408 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.79 
 
 
411 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.05 
 
 
402 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  44.78 
 
 
402 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.78 
 
 
402 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  49.57 
 
 
347 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  50.14 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.43 
 
 
347 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  48.28 
 
 
353 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.78 
 
 
346 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.43 
 
 
344 aa  332  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.29 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.85 
 
 
358 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.05 
 
 
341 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  46.2 
 
 
360 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.82 
 
 
356 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.21 
 
 
345 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.05 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.31 
 
 
362 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.48 
 
 
356 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  39.88 
 
 
340 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  41.85 
 
 
393 aa  272  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.59 
 
 
353 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.77 
 
 
356 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  40.61 
 
 
340 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.84 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.525407 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.9 
 
 
353 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal 
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.59 
 
 
353 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.486913 
 
 
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NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  39.66 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  42.86 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1666  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.7 
 
 
366 aa  262  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.792489 
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  42.69 
 
 
363 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal 
 
 
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