131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0702 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  100 
 
 
395 aa  808    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  30.16 
 
 
423 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  24.71 
 
 
457 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  39.38 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  27.27 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  26.08 
 
 
454 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  27.12 
 
 
454 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  24.04 
 
 
457 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  25.34 
 
 
452 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  24.43 
 
 
452 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  23.71 
 
 
434 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  25.9 
 
 
452 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  23.83 
 
 
455 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  24.89 
 
 
453 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1520  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  28.76 
 
 
342 aa  97.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.73 
 
 
426 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  26.22 
 
 
461 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  26.22 
 
 
461 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.44 
 
 
428 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.47 
 
 
428 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.57 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  25.88 
 
 
472 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  23.89 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  25.63 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.8 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  24.49 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.86 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  23.18 
 
 
670 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  23.15 
 
 
700 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  26.67 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  26.3 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  25.44 
 
 
522 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  24.62 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  24.35 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  22.94 
 
 
446 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  20.34 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.73 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.4 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  25.08 
 
 
679 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  23.83 
 
 
694 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  23.91 
 
 
664 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  25.25 
 
 
701 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  22.65 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  27.2 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  24.73 
 
 
678 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  23.58 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  25 
 
 
734 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  24.71 
 
 
734 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  25.08 
 
 
733 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  25.64 
 
 
558 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  22.97 
 
 
719 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  25.66 
 
 
750 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  22.97 
 
 
718 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  22.97 
 
 
718 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  22.97 
 
 
718 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  22.97 
 
 
725 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  22.97 
 
 
718 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  22.97 
 
 
725 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  23.2 
 
 
741 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  24 
 
 
511 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  25.83 
 
 
660 aa  63.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  23.45 
 
 
742 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.87 
 
 
565 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  24.3 
 
 
532 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.55 
 
 
578 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  24.79 
 
 
544 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  45.16 
 
 
724 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  24.89 
 
 
532 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  22.78 
 
 
614 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  22.78 
 
 
614 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  22.95 
 
 
596 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  38.71 
 
 
727 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  41.94 
 
 
732 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  22.96 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  21.68 
 
 
717 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  43.75 
 
 
722 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  21.57 
 
 
737 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  21.68 
 
 
717 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  25.82 
 
 
700 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  25.64 
 
 
573 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  21.57 
 
 
737 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  21.57 
 
 
737 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  22.37 
 
 
740 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  25.21 
 
 
538 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  40 
 
 
738 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  40 
 
 
738 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  40 
 
 
740 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  24.66 
 
 
567 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  23.71 
 
 
532 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  24.08 
 
 
563 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  40 
 
 
738 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  41.43 
 
 
737 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  21.86 
 
 
739 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  20.27 
 
 
518 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  23.4 
 
 
539 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  23.42 
 
 
548 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2891  hypothetical protein  21.51 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.255004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  22.13 
 
 
576 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  22.78 
 
 
545 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>