100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0637 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 		 624 aa  1290    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  71.77 
 
 		 634 aa  952    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  76.63 
 
 		 629 aa  960    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  69.15 
 
 		 635 aa  914    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.22 
 
 		 658 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.14 
 
 		 667 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  80.58 
 
 		 625 aa  1029    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.91 
 
 		 663 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.82 
 
 		 658 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.29 
 
 		 657 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.54 
 
 		 662 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.15 
 
 		 673 aa  631  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.17 
 
 		 659 aa  628  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  50.23 
 
 		 664 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.54 
 
 		 664 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.23 
 
 		 665 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.07 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.7 
 
 		 622 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.54 
 
 		 622 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  46.15 
 
 		 632 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  43.34 
 
 		 627 aa  519  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.88 
 
 		 629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36 
 
 		 590 aa  335  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.55 
 
 		 591 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  33.39 
 
 		 574 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.85 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.3 
 
 		 579 aa  287  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.29 
 
 		 563 aa  267  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.48 
 
 		 594 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.4 
 
 		 574 aa  157  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.4 
 
 		 574 aa  157  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  27.72 
 
 		 576 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  25.93 
 
 		 574 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  26.44 
 
 		 579 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  26.4 
 
 		 574 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  25.92 
 
 		 579 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  25.92 
 
 		 579 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  25.8 
 
 		 574 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  26.32 
 
 		 579 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  25.74 
 
 		 569 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  26.2 
 
 		 579 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  26.04 
 
 		 579 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  26.37 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  26.47 
 
 		 578 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  25.77 
 
 		 578 aa  126  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.61 
 
 		 556 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  25.76 
 
 		 578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.68 
 
 		 582 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  24.76 
 
 		 580 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.24 
 
 		 582 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  24.28 
 
 		 591 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  25.33 
 
 		 580 aa  111  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  26.34 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  24.41 
 
 		 954 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  23.3 
 
 		 573 aa  103  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  21.66 
 
 		 610 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.71 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  20.68 
 
 		 601 aa  67  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  29.5 
 
 		 641 aa  67  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.51 
 
 		 608 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  21.85 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.42 
 
 		 575 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  24.56 
 
 		 565 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.11 
 
 		 623 aa  54.3  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.73 
 
 		 621 aa  53.5  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.918858  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  25.66 
 
 		 573 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  23.29 
 
 		 576 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  23.95 
 
 		 633 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.09 
 
 		 637 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  24.42 
 
 		 609 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.39 
 
 		 542 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.65 
 
 		 637 aa  51.6  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  21.09 
 
 		 576 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.15 
 
 		 626 aa  50.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.93 
 
 		 570 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  21.38 
 
 		 542 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.77 
 
 		 576 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  25.44 
 
 		 555 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  26.36 
 
 		 584 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.52 
 
 		 627 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.36 
 
 		 589 aa  47.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  27.1 
 
 		 532 aa  47.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.09 
 
 		 575 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  24.37 
 
 		 550 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.75 
 
 		 578 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  25.12 
 
 		 556 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  21.43 
 
 		 538 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  20.49 
 
 		 556 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  24.29 
 
 		 577 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.61 
 
 		 606 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.58 
 
 		 598 aa  45.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  21.37 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.33 
 
 		 580 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.73 
 
 		 595 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.6 
 
 		 562 aa  44.3  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.88 
 
 		 617 aa  43.9  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.04 
 
 		 648 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  23.4 
 
 		 641 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  19.94 
 
 		 532 aa  43.9  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.15 
 
 		 599 aa  43.9  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>