More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0616 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 413 aa  807    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  46.12 
 
 		 430 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  46.27 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  45.39 
 
 		 444 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  45.39 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  44.22 
 
 		 409 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  45.64 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  45.14 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  44.55 
 
 		 443 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  45.14 
 
 		 444 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  44.42 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  44.97 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  44.97 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  44.97 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  44.97 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  48.4 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  44.03 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  41.98 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  41.98 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  41.98 
 
 		 423 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  41.33 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  41.73 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  41.73 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  41.73 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  41.35 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  41.73 
 
 		 423 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  41.73 
 
 		 423 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  44.84 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  41.94 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  42.23 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  45.66 
 
 		 411 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.41 
 
 		 411 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  45.15 
 
 		 411 aa  308  8e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  40.62 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  45.15 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.15 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  45.15 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  41.75 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  45.15 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  45.15 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  41.61 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  45.41 
 
 		 411 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  41.83 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  40.24 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  41.28 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  45.55 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  41.58 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  41.58 
 
 		 423 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 442 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  41.34 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  41.58 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  41.99 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  41.99 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  41.34 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  41.34 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  41.34 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  44.64 
 
 		 411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  41.09 
 
 		 423 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  40.76 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  42.22 
 
 		 409 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  41.33 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  41.09 
 
 		 440 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  41.09 
 
 		 440 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  41.09 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  40.59 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  40.39 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  38.98 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  40.59 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.19 
 
 		 437 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  39.61 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  41.11 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  39.61 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  39.29 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  40.05 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  40.54 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  39.47 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.26 
 
 		 409 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  41.94 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  38.42 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  39.76 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  39.56 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  38.08 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  37.65 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  38.28 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  39.76 
 
 		 434 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  40.99 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  38.76 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  38.65 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  41.47 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  39.22 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  39.32 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  37.83 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  39.07 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  38.07 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  38.07 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  37.83 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  38.59 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  38.55 
 
 		 425 aa  276  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  38.35 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>