More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0615 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  100 
 
 
403 aa  823    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  71.25 
 
 
403 aa  584  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  66.17 
 
 
405 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  50.39 
 
 
413 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  45.43 
 
 
408 aa  362  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  46.51 
 
 
404 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  45.95 
 
 
396 aa  333  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  38.52 
 
 
441 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  39.05 
 
 
404 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  38.52 
 
 
404 aa  270  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  38.26 
 
 
404 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  37.73 
 
 
404 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  37.73 
 
 
403 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  35.71 
 
 
416 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.58 
 
 
415 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  37.96 
 
 
402 aa  243  6e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  36.79 
 
 
414 aa  242  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  37.6 
 
 
401 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  36.03 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  35.4 
 
 
421 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  36.29 
 
 
401 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  36.18 
 
 
401 aa  230  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  36.65 
 
 
399 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  33.07 
 
 
404 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  37.4 
 
 
422 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  31.02 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  37.18 
 
 
423 aa  220  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  32.32 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  35.58 
 
 
419 aa  215  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.73 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  32.58 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  31.88 
 
 
437 aa  213  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  31.44 
 
 
434 aa  212  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  31.7 
 
 
454 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.63 
 
 
397 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.95 
 
 
430 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.97 
 
 
412 aa  206  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  34.54 
 
 
391 aa  203  5e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  35.84 
 
 
459 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  31.39 
 
 
432 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  31.39 
 
 
432 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31.99 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  32.82 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.58 
 
 
422 aa  196  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  35.91 
 
 
403 aa  188  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  36.13 
 
 
396 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  35.75 
 
 
406 aa  186  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  31.25 
 
 
428 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  30.69 
 
 
424 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  33.67 
 
 
420 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  31.22 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  31.75 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  28.23 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  29.79 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  29.97 
 
 
425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  30.15 
 
 
416 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  29.16 
 
 
419 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  29.15 
 
 
413 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.2 
 
 
394 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  31.05 
 
 
402 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  30.77 
 
 
426 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  30.61 
 
 
408 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  30.87 
 
 
424 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  29.46 
 
 
429 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  29.7 
 
 
411 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  32.1 
 
 
373 aa  166  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  33.81 
 
 
331 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  29.31 
 
 
428 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  34.67 
 
 
347 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0665  threonine synthase  31.63 
 
 
413 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  27.46 
 
 
418 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  31.2 
 
 
432 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.51 
 
 
356 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  27.95 
 
 
416 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  28.09 
 
 
429 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  32.1 
 
 
353 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  32.1 
 
 
353 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.69 
 
 
375 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  34.04 
 
 
356 aa  156  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  29.92 
 
 
420 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  28.54 
 
 
402 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.88 
 
 
311 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.91 
 
 
382 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  29.44 
 
 
428 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  29.71 
 
 
354 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  30.43 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  28.95 
 
 
433 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.68 
 
 
408 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  30.46 
 
 
351 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  34.04 
 
 
352 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  33.43 
 
 
348 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  33.53 
 
 
351 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  29.79 
 
 
354 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  31.52 
 
 
348 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.15 
 
 
358 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  31.19 
 
 
349 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.48 
 
 
381 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  33.13 
 
 
348 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  30.75 
 
 
353 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  32.62 
 
 
346 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>