More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0608 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.22 
 
 		 458 aa  768    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 458 aa  915    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.46 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.18 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.77 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.89 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.77 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.32 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  44.57 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.21 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.18 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.52 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.7 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.79 
 
 		 483 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.4 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.73 
 
 		 471 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 		 470 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 462 aa  355  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.01 
 
 		 450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 470 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.18 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 466 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.05 
 
 		 461 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 		 581 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 		 464 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 		 479 aa  349  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.44 
 
 		 468 aa  348  8e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.54 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.54 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.54 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 476 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 476 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 476 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 		 470 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 		 496 aa  347  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.36 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.01 
 
 		 459 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 		 598 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.25 
 
 		 468 aa  345  8.999999999999999e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0532  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0112141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 		 459 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>