More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0593 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
206 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.07 
 
 
221 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  47.62 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.35 
 
 
207 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.72 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.83 
 
 
215 aa  164  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.69 
 
 
220 aa  164  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.56 
 
 
223 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.5 
 
 
219 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.81 
 
 
224 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.93 
 
 
352 aa  158  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.75 
 
 
211 aa  158  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
217 aa  157  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.41 
 
 
352 aa  157  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.74 
 
 
212 aa  157  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.38 
 
 
352 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  41.75 
 
 
213 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.43 
 
 
365 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.72 
 
 
343 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
356 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.72 
 
 
343 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
223 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.56 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.16 
 
 
216 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.43 
 
 
346 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.08 
 
 
213 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.01 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.63 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.01 
 
 
218 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.94 
 
 
223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
224 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 
219 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
219 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.17 
 
 
210 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
217 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
219 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.35 
 
 
214 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.08 
 
 
219 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
207 aa  148  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 
343 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.84 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.58 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.06 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.39 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.21 
 
 
368 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.54 
 
 
219 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.54 
 
 
219 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.27 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.53 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
360 aa  144  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.62 
 
 
236 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
208 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.79 
 
 
353 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
218 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.38 
 
 
222 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.07 
 
 
221 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
218 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.31 
 
 
351 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.5 
 
 
347 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
206 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.35 
 
 
206 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.79 
 
 
215 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.07 
 
 
204 aa  141  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 
206 aa  141  8e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.97 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.12 
 
 
379 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  41.38 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  44.5 
 
 
484 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.93 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  41.21 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.3 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.3 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.27 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
220 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.58 
 
 
206 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  42.27 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
207 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77822  predicted protein  36.97 
 
 
533 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00729956  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
492 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.61 
 
 
220 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.53 
 
 
351 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.24 
 
 
207 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.69 
 
 
344 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
350 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  39.51 
 
 
478 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  41.71 
 
 
479 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.63 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.11 
 
 
350 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
484 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03710  thiamine biosynthetic bifunctional enzyme, putative  38.89 
 
 
555 aa  134  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.036727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.56 
 
 
226 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.79 
 
 
204 aa  134  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2443  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.49 
 
 
206 aa  134  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0164937  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.3 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>