24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0584 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  836    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0980  hypothetical protein  29.4 
 
 
406 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0776  hypothetical protein  29.72 
 
 
459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0148333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0491  hypothetical protein  27.8 
 
 
425 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0671  hypothetical protein  28.13 
 
 
417 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4399  hypothetical protein  28.22 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2730  hypothetical protein  26.2 
 
 
403 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3061  hypothetical protein  25.78 
 
 
401 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.943774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  40.74 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  28.48 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  26.76 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  35.71 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  35 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  27.15 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  25.83 
 
 
392 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  24.34 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  27.39 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  34.12 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  28.78 
 
 
391 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  31.03 
 
 
395 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  28.77 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  26.62 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  22.95 
 
 
426 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  32.1 
 
 
391 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>