59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0583 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  100 
 
 
1109 aa  2273    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  30.05 
 
 
1113 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  31.9 
 
 
1159 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  31.96 
 
 
1207 aa  495  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  29.96 
 
 
1107 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  28.3 
 
 
1093 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  24.12 
 
 
1140 aa  213  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  24.47 
 
 
1141 aa  213  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  22.64 
 
 
1138 aa  175  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  21.19 
 
 
1159 aa  157  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  21.56 
 
 
1214 aa  149  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  21.85 
 
 
1125 aa  106  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  26.67 
 
 
1228 aa  99.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  20.39 
 
 
1159 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  20.67 
 
 
1159 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  21 
 
 
1123 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  21.92 
 
 
1145 aa  89.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  22.46 
 
 
1121 aa  84.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  21.24 
 
 
1124 aa  81.6  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  20.4 
 
 
1125 aa  73.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  27.16 
 
 
1120 aa  60.1  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  26.12 
 
 
1166 aa  59.7  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.87 
 
 
1144 aa  59.3  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  21.88 
 
 
1121 aa  58.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  22.24 
 
 
1130 aa  58.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.55 
 
 
1114 aa  58.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  22.22 
 
 
1120 aa  58.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  21.62 
 
 
1126 aa  57.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.87 
 
 
1143 aa  57.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.32 
 
 
1122 aa  56.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  25.85 
 
 
1143 aa  52.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  24.88 
 
 
1121 aa  52.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  24.23 
 
 
1120 aa  52  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  23.47 
 
 
1120 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  23.47 
 
 
1120 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  23.5 
 
 
1121 aa  50.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  23.94 
 
 
1353 aa  51.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  23.47 
 
 
1118 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  20.27 
 
 
1133 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  23.64 
 
 
1125 aa  50.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  24 
 
 
1146 aa  50.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  30.12 
 
 
1136 aa  50.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  24.31 
 
 
1121 aa  49.7  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  28.57 
 
 
1118 aa  49.3  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  30.6 
 
 
1121 aa  48.5  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4769  SMC domain-containing protein  24.02 
 
 
944 aa  48.9  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.959712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  31.86 
 
 
1388 aa  48.9  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  28.22 
 
 
1133 aa  48.1  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  28.99 
 
 
1140 aa  47.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  23.04 
 
 
1124 aa  47.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.01 
 
 
1126 aa  47  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  32.61 
 
 
1146 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1493  SMC domain protein  32.88 
 
 
1199 aa  45.8  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.326232  hitchhiker  0.0000000327105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  22.53 
 
 
944 aa  45.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  25.24 
 
 
1354 aa  45.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  22.29 
 
 
944 aa  45.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  21.03 
 
 
1151 aa  45.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  21.7 
 
 
1370 aa  45.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0866  cell division protein MukB  27.15 
 
 
1468 aa  44.7  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>