59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0537 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 		 329 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.87 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.24 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.71 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.3 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.41 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  35.64 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.76 
 
 		 305 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.05 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.29 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  30.2 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.85 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  29.6 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  30.28 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.13 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.43 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  30.33 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  26.99 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.13 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.94 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  29.26 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  26.75 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.16 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  29.17 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.42 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.51 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  36.8 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.5 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  25.42 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  36.36 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.93 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.98 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  28 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  31.45 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.25 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.21 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  25.4 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.75 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  33.08 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  24.37 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  50 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  26.73 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  35.48 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.03 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.69 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  25.6 
 
 		 286 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.98 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  25.42 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  48.08 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  43.48 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  32.74 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  25.4 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  24.21 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.54 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  28 
 
 		 280 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  51.02 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.47 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>