More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0493 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  100 
 
 
383 aa  789  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  41.88 
 
 
385 aa  301  9e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  40.75 
 
 
370 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  42.51 
 
 
390 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  43.09 
 
 
386 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  38.36 
 
 
435 aa  285  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  39.95 
 
 
368 aa  285  8e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  39.53 
 
 
381 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  38.61 
 
 
370 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  38.67 
 
 
369 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  37.6 
 
 
369 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  37.33 
 
 
369 aa  254  2e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  38.99 
 
 
379 aa  254  2e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  37.7 
 
 
392 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.67 
 
 
374 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.67 
 
 
374 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  38.16 
 
 
400 aa  245  1e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  35.35 
 
 
389 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  38.25 
 
 
383 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  34.96 
 
 
370 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  36.86 
 
 
377 aa  221  1e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.62 
 
 
387 aa  221  2e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  36.98 
 
 
414 aa  219  8e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  34.11 
 
 
378 aa  219  9e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  36.05 
 
 
391 aa  214  2e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  33.06 
 
 
477 aa  213  5e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  32.98 
 
 
373 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  34.38 
 
 
378 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  34.67 
 
 
363 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  33.25 
 
 
388 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  33.42 
 
 
391 aa  198  1e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  32.88 
 
 
377 aa  198  2e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  37.38 
 
 
325 aa  196  4e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  31.71 
 
 
376 aa  193  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  32.18 
 
 
392 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  31.43 
 
 
463 aa  189  6e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  30.83 
 
 
413 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  35.67 
 
 
305 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  30.79 
 
 
426 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  29.54 
 
 
391 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  31.25 
 
 
404 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.67 
 
 
416 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.91 
 
 
379 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.91 
 
 
379 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.78 
 
 
381 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  29.12 
 
 
386 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  31.41 
 
 
357 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  32.05 
 
 
381 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.09 
 
 
422 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.41 
 
 
402 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.76 
 
 
374 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.25 
 
 
431 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.69 
 
 
376 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.33 
 
 
376 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.33 
 
 
376 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.8 
 
 
422 aa  152  9e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  27.89 
 
 
406 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.6 
 
 
376 aa  148  2e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.52 
 
 
378 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  28.16 
 
 
451 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  32.57 
 
 
506 aa  142  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.09 
 
 
371 aa  141  2e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  30.26 
 
 
367 aa  141  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.3 
 
 
376 aa  141  2e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.13 
 
 
437 aa  140  5e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  28.2 
 
 
409 aa  140  5e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.4 
 
 
403 aa  135  1e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  29.25 
 
 
487 aa  134  2e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.81 
 
 
443 aa  134  4e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  26.58 
 
 
409 aa  132  1e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.43 
 
 
416 aa  132  1e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.55 
 
 
442 aa  129  9e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  29.74 
 
 
393 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  28.45 
 
 
656 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  50 
 
 
121 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.57 
 
 
384 aa  121  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  28.53 
 
 
385 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.3 
 
 
370 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.56 
 
 
407 aa  118  2e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.19 
 
 
443 aa  118  2e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  25.71 
 
 
460 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.22 
 
 
423 aa  115  1e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  25.71 
 
 
404 aa  115  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  27.91 
 
 
374 aa  115  1e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  25.44 
 
 
507 aa  115  2e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.34 
 
 
365 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  25.8 
 
 
394 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.3 
 
 
388 aa  114  4e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  25.28 
 
 
374 aa  114  4e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  25 
 
 
407 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  28.74 
 
 
407 aa  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.93 
 
 
380 aa  111  2e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  32.47 
 
 
471 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  32.47 
 
 
471 aa  109  7e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.61 
 
 
387 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.77 
 
 
356 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  27.64 
 
 
494 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  25.93 
 
 
357 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  22.66 
 
 
387 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  38.18 
 
 
429 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>