More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0484 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1078    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  43.1 
 
 		 506 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 528 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  35.16 
 
 		 526 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  35.43 
 
 		 523 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  35.93 
 
 		 535 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  36.09 
 
 		 534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  33.83 
 
 		 524 aa  246  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  31.21 
 
 		 541 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.83 
 
 		 520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  32.01 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 528 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  32.22 
 
 		 532 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 		 565 aa  230  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  32.22 
 
 		 535 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 		 535 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  31.19 
 
 		 535 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.71 
 
 		 526 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.5 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.5 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.5 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.69 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.29 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.44 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 543 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 553 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 531 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.04 
 
 		 547 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  30.61 
 
 		 547 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 532 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  31.19 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.19 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  31.19 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  31.19 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  31.57 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.57 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  31.57 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.15 
 
 		 535 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 501 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3923  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 528 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333304  normal  0.449349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 544 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  30.99 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4568  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  29.71 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3416  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.680015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.84 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 537 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  28.89 
 
 		 589 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  28.97 
 
 		 537 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.71 
 
 		 542 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 531 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2067  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.78 
 
 		 553 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  29.82 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 532 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 546 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 506 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.64 
 
 		 536 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 588 aa  203  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4350  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 553 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.801154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4016  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 553 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.64 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.64 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.64 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 531 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  32.43 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.43 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  32.43 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.01 
 
 		 542 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>