More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0471 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  37.15 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  37.73 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  37.73 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  37.73 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  37.73 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  37.15 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  37.15 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  36.64 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  36.31 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  36.42 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  34.38 
 
 		 346 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  33.76 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  35.26 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  34.46 
 
 		 354 aa  202  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  34.8 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  35.56 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  31.08 
 
 		 351 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.08 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  34.24 
 
 		 346 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  33.55 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  31.97 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  31.97 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  31.97 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  30.77 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  32.62 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  33.65 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  36.91 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  34.19 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  33.97 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  31.21 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.9 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  33.55 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  31.45 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  31.45 
 
 		 350 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 		 351 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  32.41 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  34.63 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  32.81 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 		 355 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  31.15 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.24 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  30.82 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.66 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  29.5 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  31.03 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  32.89 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.72 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  33.44 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  31.78 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 		 509 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  31.78 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.29 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  32.36 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 		 368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.22 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.16 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  26.05 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  25.07 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.92 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.62 
 
 		 376 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  37.93 
 
 		 182 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  33.07 
 
 		 531 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  40.74 
 
 		 146 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 668 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  30.26 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 662 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  24.1 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 771 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 		 568 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  33.57 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.91 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.99 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.99 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  28.99 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.99 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  27.53 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.99 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.99 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.99 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  28.78 
 
 		 420 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  28.78 
 
 		 420 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  23.2 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>