22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0465 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  41.67 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  44.68 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  36.54 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  30.99 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  41.54 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  36.73 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  33.82 
 
 		 249 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  30.86 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  46.51 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  32.39 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  39.62 
 
 		 386 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  31.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  31.37 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  35.09 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  34.48 
 
 		 323 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  58.62 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  56.25 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>