More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0454 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  54.13 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  45.71 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.68 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  40 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  37.02 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 517 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  38.1 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  40.21 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  36.54 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  36.19 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  32.8 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  31.22 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  30.69 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  30.16 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  30.16 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  30.16 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  30.16 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  30.16 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  30.16 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  29.05 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  38.16 
 
 		 301 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 373 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  38.06 
 
 		 346 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 		 373 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 405 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.97 
 
 		 369 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  44.74 
 
 		 366 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.01 
 
 		 385 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  36.09 
 
 		 381 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.02 
 
 		 352 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.77 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  44.74 
 
 		 366 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.02 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.02 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  39.1 
 
 		 394 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.4 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.4 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.4 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 351 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.02 
 
 		 352 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 393 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 		 364 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  32.48 
 
 		 402 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  37.59 
 
 		 404 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 		 421 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 352 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 359 aa  98.2  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 344 aa  98.2  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  37.69 
 
 		 410 aa  98.2  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 		 328 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 		 348 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  30.99 
 
 		 413 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  32.11 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  34.78 
 
 		 331 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  34.85 
 
 		 332 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 383 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 358 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  31.85 
 
 		 411 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 401 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  34.07 
 
 		 383 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 368 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 		 401 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 368 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 		 371 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  32.12 
 
 		 342 aa  95.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 375 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  34.56 
 
 		 390 aa  95.1  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  34.59 
 
 		 397 aa  94.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  39.85 
 
 		 443 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  34.69 
 
 		 372 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  31.79 
 
 		 355 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  43.28 
 
 		 413 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  39.18 
 
 		 407 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 394 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1634  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 453 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 349 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  31.82 
 
 		 382 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  29.41 
 
 		 393 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 347 aa  92.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  35.94 
 
 		 348 aa  92  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 367 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  32.59 
 
 		 325 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003356  multidrug resistance efflux pump  35.53 
 
 		 271 aa  91.7  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000276837  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 		 374 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 		 334 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  38.21 
 
 		 363 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 		 383 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  35.66 
 
 		 342 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  35.66 
 
 		 355 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  31.82 
 
 		 344 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  32.58 
 
 		 352 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  33.58 
 
 		 459 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 360 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 422 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  32.58 
 
 		 371 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  33.55 
 
 		 395 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  31.28 
 
 		 368 aa  89.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>