More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0421 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  69.15 
 
 
285 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  68.82 
 
 
279 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  63.74 
 
 
286 aa  350  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  64.37 
 
 
285 aa  345  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  65.53 
 
 
287 aa  335  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  64.29 
 
 
287 aa  331  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  55.4 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  63.26 
 
 
287 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  58.27 
 
 
282 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  55.23 
 
 
282 aa  315  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  59.5 
 
 
280 aa  315  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  59.14 
 
 
280 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  58.87 
 
 
284 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  58.87 
 
 
284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  62.36 
 
 
285 aa  308  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  58.17 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  53.05 
 
 
285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  59.7 
 
 
280 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  56.2 
 
 
283 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  52.33 
 
 
286 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  50.35 
 
 
296 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  52.11 
 
 
287 aa  280  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  55.29 
 
 
295 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  50.36 
 
 
318 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  50.54 
 
 
294 aa  275  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  52.96 
 
 
307 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  52.65 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  50.19 
 
 
296 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  51.79 
 
 
308 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  48.94 
 
 
296 aa  270  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  49.47 
 
 
280 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  54.58 
 
 
307 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  48.94 
 
 
290 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  52.16 
 
 
286 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  48.21 
 
 
285 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  54 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  48.93 
 
 
283 aa  265  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  48.58 
 
 
285 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  46.43 
 
 
282 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  49.11 
 
 
280 aa  265  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  49.11 
 
 
280 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  52.43 
 
 
285 aa  264  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  47.5 
 
 
306 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  48.57 
 
 
279 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  52.69 
 
 
281 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  47.5 
 
 
288 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  47.86 
 
 
285 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  48.21 
 
 
283 aa  262  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  48.75 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  47.14 
 
 
296 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  48.93 
 
 
286 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  48.4 
 
 
313 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  47.52 
 
 
288 aa  261  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  49.02 
 
 
291 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  48.92 
 
 
293 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  47.69 
 
 
320 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  49.46 
 
 
294 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  47.14 
 
 
285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  47.14 
 
 
285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  47.14 
 
 
285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  47.14 
 
 
285 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  47.14 
 
 
285 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  47.31 
 
 
307 aa  256  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  48.03 
 
 
316 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  49.1 
 
 
285 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  46.98 
 
 
320 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  48.24 
 
 
300 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  48.24 
 
 
300 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  49.47 
 
 
285 aa  254  9e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  49.82 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  48.75 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  52.09 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  49.82 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  47.16 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  50.18 
 
 
281 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  47.5 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  48.57 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  51.59 
 
 
309 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  47.16 
 
 
299 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  47.5 
 
 
286 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  48.58 
 
 
286 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  47.33 
 
 
284 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  46.98 
 
 
317 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  46.71 
 
 
343 aa  250  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  47.69 
 
 
293 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  48.03 
 
 
287 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  48.21 
 
 
274 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  49.28 
 
 
280 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  49.01 
 
 
289 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  48.81 
 
 
289 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>