164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0357 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 
284 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  55.44 
 
 
285 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  49.08 
 
 
286 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  50.55 
 
 
283 aa  281  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  47.43 
 
 
299 aa  279  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.75 
 
 
462 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  42.91 
 
 
296 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  43.82 
 
 
294 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.45 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.09 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.09 
 
 
295 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.78 
 
 
317 aa  238  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.73 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  41.51 
 
 
502 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.44 
 
 
317 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.79 
 
 
326 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.81 
 
 
293 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.35 
 
 
334 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  38.81 
 
 
502 aa  223  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  43.75 
 
 
308 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  39.62 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.25 
 
 
508 aa  218  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.11 
 
 
502 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.43 
 
 
497 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.57 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.57 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.48 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.57 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.97 
 
 
288 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.39 
 
 
281 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  39.93 
 
 
299 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.63 
 
 
295 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.98 
 
 
290 aa  209  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.73 
 
 
306 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  38.33 
 
 
290 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  37.81 
 
 
349 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.69 
 
 
295 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.48 
 
 
305 aa  201  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.32 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.2 
 
 
294 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.41 
 
 
306 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.56 
 
 
303 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.62 
 
 
303 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  32.88 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  37.59 
 
 
281 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.65 
 
 
291 aa  188  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.82 
 
 
305 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.2 
 
 
302 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  32.31 
 
 
301 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.55 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  34.55 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  33.33 
 
 
296 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  37.18 
 
 
296 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.74 
 
 
301 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.13 
 
 
302 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.07 
 
 
282 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.53 
 
 
297 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  36 
 
 
282 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.06 
 
 
296 aa  176  6e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.2 
 
 
297 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.53 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  33.45 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.18 
 
 
282 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.18 
 
 
282 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  33.82 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.73 
 
 
282 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.82 
 
 
282 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.07 
 
 
293 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  35.42 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  31.75 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.25 
 
 
320 aa  163  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  31.75 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  30.71 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.36 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  30.71 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.1 
 
 
304 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  32.26 
 
 
295 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  33.09 
 
 
282 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  31.23 
 
 
297 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  34.41 
 
 
306 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  34.75 
 
 
292 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.86 
 
 
276 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  32.52 
 
 
308 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  31.88 
 
 
282 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.33 
 
 
300 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  30.8 
 
 
285 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.94 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  29.64 
 
 
293 aa  153  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.02 
 
 
278 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  31.18 
 
 
296 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.25 
 
 
300 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  32.54 
 
 
300 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.14 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.82 
 
 
296 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.25 
 
 
297 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.88 
 
 
307 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  24.29 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.18 
 
 
348 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  26.17 
 
 
423 aa  65.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>