More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0353 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  41.83 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  32.37 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  32.53 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  31.46 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  30.98 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  30.89 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.08 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 281 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  29.74 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.85 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 274 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.28 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 286 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 504 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 282 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 		 277 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.37 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 317 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 397 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  27 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.2 
 
 		 425 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  27.8 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  27.67 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.8 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.02 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  27.44 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.17 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.17 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.17 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  27.2 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.22 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.71 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  30.17 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  26.58 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>