More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0339 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0339  integral membrane protein TerC  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0578  Integral membrane protein TerC  63.16 
 
 
247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.592878 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0387  integral membrane protein TerC  50.4 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4857  putative tellurium resistance protein  51.6 
 
 
263 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.002558  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0516  putative tellurium resistance protein  50.8 
 
 
263 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000032211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0376  TerC family integral membrane protein  50.4 
 
 
263 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0516  tellurium resistance protein, putative  50.8 
 
 
263 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0467  putative tellurium resistance protein  50 
 
 
263 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0388  tellurium resistance protein  50 
 
 
263 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000390174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0379  TerC family integral membrane protein  50 
 
 
263 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000163216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0402  tellurium resistance protein  50 
 
 
263 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.221092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0446  putative tellurium resistance protein  50 
 
 
263 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0382  integral membrane protein TerC  50 
 
 
263 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1824  integral membrane protein TerC  41.06 
 
 
251 aa  180  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0089  hypothetical protein  41.83 
 
 
260 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2785  membrane protein TerC  46 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0990  Integral membrane protein TerC  44.69 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  39.63 
 
 
271 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1776  integral membrane protein TerC  40.09 
 
 
259 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.221136  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1296  Integral membrane protein TerC  43.43 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0964782  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  40 
 
 
266 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0992  Integral membrane protein TerC  37.38 
 
 
233 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4213  tellurium resistance protein TerC  33.76 
 
 
285 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537903  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2235  integral membrane protein TerC  38.1 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1038  integral membrane protein TerC  35.96 
 
 
267 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00785586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1019  integral membrane protein TerC  35.96 
 
 
267 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0610  TerC family integral membrane protein  39.9 
 
 
268 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00407754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1036  integral membrane protein TerC  38.5 
 
 
267 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  37.8 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0443  tellurium resistance protein TerC  32.08 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1298  Integral membrane protein TerC  35.91 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.843516  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1422  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1462  membrane protein, TerC family  36.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1200  TerC family integral membrane protein  36.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1202  TerC family integral membrane protein  36.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0439285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3984  membrane protein, TerC family  36.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1398  membrane protein, TerC family  36.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1360  membrane protein, TerC family  36.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1223  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1322  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1297  Integral membrane protein TerC  34.27 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.308093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1224  integral membrane protein TerC  35.89 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0549  hypothetical protein  34.09 
 
 
253 aa  109  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2572  tellurium resistance protein TerC  31.75 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2829  Integral membrane protein TerC  32.09 
 
 
245 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0867019  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1844  Integral membrane protein TerC  30.09 
 
 
239 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3425  hypothetical protein  31.22 
 
 
240 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1578  integral membrane protein TerC  34.92 
 
 
258 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22538  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1304  TerC family protein  31.58 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.666261  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09251  tellurium resistance protein TerC  29.74 
 
 
236 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0654271  hitchhiker  0.00000817994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1024  Integral membrane protein TerC  32.12 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0081641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2338  Integral membrane protein TerC  29.05 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  27.44 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  29.28 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4409  Integral membrane protein TerC  29.63 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  29.36 
 
 
249 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  27.23 
 
 
249 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  29.44 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  29.46 
 
 
373 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  27.6 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  26.8 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  26.24 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  28.46 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4472  Integral membrane protein TerC  29.44 
 
 
254 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  27.19 
 
 
241 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
518 aa  85.9  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2902  integral membrane protein TerC  27.07 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.807584  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  31.25 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  27.73 
 
 
343 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  25.23 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  26.58 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0367  membrane protein TerC  31.63 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
522 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  25.81 
 
 
528 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  26.11 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  27.07 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  26.64 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  29.49 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  30.13 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0960  hypothetical protein  31.34 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0967888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  27.82 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  27 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10491  tellurium resistance protein TerC  31.41 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120538  hitchhiker  0.00269947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  26.51 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  26.64 
 
 
514 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  29.2 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  25.73 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  27.8 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  25.43 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  24.55 
 
 
516 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1171  TerC family protein  28.9 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.674887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  28.24 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  25.57 
 
 
577 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  24.55 
 
 
518 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  24.55 
 
 
518 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  24.55 
 
 
518 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  24.55 
 
 
518 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  28.57 
 
 
522 aa  82  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  24.55 
 
 
518 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>