58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0310 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
484 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  99.6 
 
 
484 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
484 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
484 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
484 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
484 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
484 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
484 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
484 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  39.92 
 
 
451 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1623  hypothetical protein  92.94 
 
 
85 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  28.91 
 
 
420 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  21.48 
 
 
457 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  21.48 
 
 
456 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1145  hypothetical protein  23.04 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  23.4 
 
 
472 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  23.64 
 
 
472 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  23.78 
 
 
472 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 
472 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  22.84 
 
 
472 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1749  hypothetical protein  24.68 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.167509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  24.4 
 
 
465 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  23.79 
 
 
443 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  30.23 
 
 
439 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  22.61 
 
 
494 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2093  hypothetical protein  24.47 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.438808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  34.18 
 
 
466 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
446 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
446 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  29.46 
 
 
629 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0684  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0758  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.686568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0768  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0939  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1159  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00129993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1521  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.626511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2000  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2274  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
455 aa  42  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>