More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0308 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 151 aa  156  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  48.25 
 
 		 144 aa  133  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0501  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  31.01 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.81 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  38.1 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.07 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  34.38 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  30.77 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.97 
 
 		 316 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  29.55 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  29.55 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  29.55 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.15 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  35.82 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 219 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>