More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0278 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  63.97 
 
 
459 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  100 
 
 
460 aa  954    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 
464 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  65.72 
 
 
461 aa  665    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  66.29 
 
 
458 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  74.72 
 
 
456 aa  723    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  69.75 
 
 
459 aa  666    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  61.28 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  61.14 
 
 
461 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  62.08 
 
 
458 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  61.73 
 
 
458 aa  598  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  60.62 
 
 
458 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  61.5 
 
 
458 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  61.42 
 
 
458 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  61.64 
 
 
458 aa  591  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  58.48 
 
 
466 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  57.65 
 
 
462 aa  568  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  57.11 
 
 
462 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  56.89 
 
 
462 aa  564  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 
462 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 
462 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 
462 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 
463 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 
462 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  56.67 
 
 
462 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  57.21 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  57.43 
 
 
463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  57.77 
 
 
467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  56.89 
 
 
462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  58.21 
 
 
461 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  57.96 
 
 
459 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  56.54 
 
 
462 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  59.64 
 
 
441 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  57.93 
 
 
481 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  58.18 
 
 
469 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  57.96 
 
 
464 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  58.47 
 
 
467 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  55.92 
 
 
461 aa  549  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 
478 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  57.05 
 
 
464 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  57.49 
 
 
464 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  56.86 
 
 
464 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  57.27 
 
 
464 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  55.7 
 
 
491 aa  543  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  56.53 
 
 
465 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  56.64 
 
 
464 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  56.39 
 
 
462 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  56.28 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  55.7 
 
 
469 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  57.37 
 
 
467 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  56.42 
 
 
466 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  56.35 
 
 
464 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  56.38 
 
 
463 aa  536  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 
457 aa  538  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  56.79 
 
 
464 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  55.29 
 
 
457 aa  536  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 
468 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  56.42 
 
 
499 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  56.14 
 
 
475 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  56.57 
 
 
464 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  56.7 
 
 
460 aa  532  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  55.82 
 
 
462 aa  529  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  56.8 
 
 
462 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  56.8 
 
 
462 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  54.17 
 
 
459 aa  531  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  55.14 
 
 
468 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  55.12 
 
 
459 aa  525  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  55.48 
 
 
466 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  56.8 
 
 
462 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  57.24 
 
 
441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  53.85 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  54.85 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  55.58 
 
 
462 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  54.97 
 
 
461 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  54.65 
 
 
476 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  52.75 
 
 
458 aa  511  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  53.47 
 
 
460 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 
461 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  55.38 
 
 
462 aa  508  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
459 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  51.75 
 
 
459 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  52.3 
 
 
466 aa  504  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 
462 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  53.44 
 
 
468 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  53.29 
 
 
462 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  52.74 
 
 
473 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  54.07 
 
 
463 aa  501  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  52.43 
 
 
467 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  53.28 
 
 
472 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  54.36 
 
 
470 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  55.25 
 
 
463 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
466 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  52.98 
 
 
461 aa  498  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  55.07 
 
 
474 aa  499  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  53.93 
 
 
472 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 
464 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
461 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  53.45 
 
 
471 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  52.32 
 
 
461 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>