More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0277 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 401 aa  809    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  80.55 
 
 		 401 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  76.81 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  74.69 
 
 		 408 aa  621  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  74.75 
 
 		 405 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  71.75 
 
 		 404 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  69.04 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  69.77 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  67.18 
 
 		 410 aa  568  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  66.5 
 
 		 1496 aa  554  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  64.14 
 
 		 403 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  65.08 
 
 		 403 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  64.05 
 
 		 407 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  64.27 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  64.23 
 
 		 407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  63.64 
 
 		 402 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  62.98 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  62.53 
 
 		 407 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  60.71 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  61.13 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  59.95 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  58.88 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  60.76 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  59.49 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  57.68 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  58.69 
 
 		 401 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  57.18 
 
 		 405 aa  471  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  59.55 
 
 		 406 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  59.18 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  58.1 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  58.99 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  57.97 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  56.23 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  56.57 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  55.73 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  56.35 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  57.61 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  57.22 
 
 		 402 aa  454  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4779  argininosuccinate synthase  57.14 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  58.31 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  56.78 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  58.12 
 
 		 404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  58.5 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  57.61 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  57.36 
 
 		 407 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  54.8 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  59.16 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  54.8 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  57.76 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  57.32 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  58.21 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  57.11 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  55.81 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  55.3 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  57.96 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  56.92 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  56.6 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  57.96 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  57.96 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  56 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  56.5 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0979  argininosuccinate synthase  56.35 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  57.32 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  53.79 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  57.46 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  56.43 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  55.67 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  55.41 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  54.9 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  55.2 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  57 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  53.87 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0332  argininosuccinate synthase  56.57 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  56.78 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  56.28 
 
 		 406 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  56.2 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  54.64 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  56.12 
 
 		 408 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  55.28 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  56.03 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  56.2 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  53.87 
 
 		 401 aa  434  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0205  argininosuccinate synthase  56.49 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0568  Argininosuccinate synthase  56.46 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  55.58 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  56.03 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0404  argininosuccinate synthase  56.46 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  55.47 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  55.98 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  54.07 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  55.98 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  55.98 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2218  argininosuccinate synthase  55.87 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0259  argininosuccinate synthase  56.06 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00529  argininosuccinate synthase  54.41 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  56.5 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  54.61 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  54.32 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>