More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0276 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 315 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  65.92 
 
 		 320 aa  447  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  62.3 
 
 		 313 aa  428  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  66.45 
 
 		 307 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  65.98 
 
 		 305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  60.06 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  64.71 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  60.4 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  60.78 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  57.57 
 
 		 303 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  57.24 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  57.43 
 
 		 305 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 		 312 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  58.42 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 309 aa  362  6e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 		 300 aa  361  9e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  56.82 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  56.82 
 
 		 316 aa  359  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  56.49 
 
 		 316 aa  358  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 		 302 aa  358  9e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 		 303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  55.96 
 
 		 308 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 		 316 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 		 316 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 		 316 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 		 316 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 		 317 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 306 aa  352  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 		 309 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 		 303 aa  349  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  54.58 
 
 		 323 aa  349  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  58.82 
 
 		 305 aa  349  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 		 302 aa  348  8e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  53.75 
 
 		 304 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 302 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 305 aa  344  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 301 aa  341  7e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 303 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  53.25 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 304 aa  335  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  55.99 
 
 		 304 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  55.34 
 
 		 306 aa  328  6e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 		 301 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  53.23 
 
 		 306 aa  325  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  52.92 
 
 		 306 aa  325  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 304 aa  325  5e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  50.82 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 305 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 305 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  51.29 
 
 		 323 aa  322  6e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 		 312 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  51.95 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  51.95 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  51.29 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 312 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 		 305 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 312 aa  318  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  51.47 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  52.26 
 
 		 313 aa  315  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  53.79 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  51.6 
 
 		 313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  52.17 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 		 309 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>