294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0270 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  62.02 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  62.72 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  58.04 
 
 		 337 aa  360  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  54.93 
 
 		 294 aa  325  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  55.9 
 
 		 332 aa  322  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  51.05 
 
 		 282 aa  319  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  52.82 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  50.17 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  47.39 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  47.39 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  48.6 
 
 		 332 aa  292  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  51.09 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  50.36 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  49.13 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  48.24 
 
 		 331 aa  285  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  48.24 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  46.76 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  46.29 
 
 		 326 aa  278  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  46.23 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  43.71 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  44.18 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  45.23 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  44.37 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  44.41 
 
 		 356 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  44.67 
 
 		 337 aa  252  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  44.37 
 
 		 336 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 		 336 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  41.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  45.49 
 
 		 334 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  43.69 
 
 		 336 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 		 356 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  42.76 
 
 		 337 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  42.86 
 
 		 336 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 343 aa  245  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  41.75 
 
 		 345 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  42.96 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 		 337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  41.41 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  43.15 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  41.24 
 
 		 336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  41.41 
 
 		 345 aa  238  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 		 370 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 		 372 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  42.71 
 
 		 342 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  41.96 
 
 		 365 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  43.49 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  42.32 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  39.51 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  39.51 
 
 		 358 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  39.1 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 374 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  39.79 
 
 		 382 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 		 337 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 337 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  40.27 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  40 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  38.89 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  39.93 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  41.32 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  41.46 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  42.75 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  40.6 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0239  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 367 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  40.54 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  38.11 
 
 		 361 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  38.11 
 
 		 361 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 		 362 aa  221  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 361 aa  221  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  39.16 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 		 396 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  39.37 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  38.78 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  38.23 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  42.76 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  38.93 
 
 		 362 aa  208  9e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 339 aa  204  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 376 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  36.49 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  38.49 
 
 		 384 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>