More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0267 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0267  flagellar biosynthesis  100 
 
 
90 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  49.43 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  45.88 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  53.01 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2366  hypothetical protein  53.85 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0972  FlhB domain protein  47.62 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  43.02 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  47.62 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  43.82 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  42.5 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  43.21 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  45.33 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  43.21 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  44.87 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  48.05 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  44.87 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  49.35 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1760  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  42.22 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000598623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1351  flagellar protein with uncharacterized cytoplasmic FhlB domain-like protein  44.19 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  44.58 
 
 
89 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  40.7 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  42.86 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  42.86 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0406  type III secretion exporter  45.83 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.715015  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  44 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  43.9 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  45.71 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  43.9 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  41.03 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  46.15 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  41.38 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  43.18 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  41.77 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  41.38 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.45 
 
 
350 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  43.37 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0307  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.24 
 
 
363 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  40.7 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  39.77 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3235  flagellar biosynthesis protein  40 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1359  type III secretion exporter  45.33 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  45 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2594  type III secretion exporter  45.33 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1370  FlhB domain-containing protein  46.58 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2498  type III secretion exporter  45.33 
 
 
355 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.59 
 
 
361 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0161  flagellar biosynthesis protein  44.83 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2261  type III secretion exporter  38.55 
 
 
365 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1669  type III secretion exporter  44.44 
 
 
360 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.058762  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1153  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.66 
 
 
356 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.76 
 
 
392 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  41.18 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  44.58 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  50.67 
 
 
381 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.3 
 
 
380 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  41.67 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3038  flagellar biosynthesis protein  40 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  39.19 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  45.83 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  38.64 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  42.11 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  35 
 
 
351 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  44 
 
 
374 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  43.68 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  43.24 
 
 
354 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.59 
 
 
358 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  46.15 
 
 
352 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.75 
 
 
353 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  40.91 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.97 
 
 
377 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  38.64 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.25 
 
 
350 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.74 
 
 
359 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.54 
 
 
381 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2923  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.75 
 
 
379 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37481  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
361 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0155  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.74 
 
 
357 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.795808  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  40.91 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  42.86 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  41.46 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2328  type III secretion exporter  43.21 
 
 
363 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645604  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  42.53 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.24 
 
 
359 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0278  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.94 
 
 
372 aa  54.7  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  45.95 
 
 
380 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1214  type III secretion exporter  39.51 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2926  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.77 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  42.53 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.59 
 
 
390 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3765  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.77 
 
 
119 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.943439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
363 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  41.77 
 
 
101 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.74 
 
 
360 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1519  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.89 
 
 
383 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.24 
 
 
354 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  41.98 
 
 
422 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1547  flagellar protein FhlB-like protein  33.77 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.178027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1093  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.03 
 
 
358 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  40 
 
 
366 aa  53.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>