More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0256 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
143 aa  298  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.58972e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  71.74 
 
 
148 aa  215  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.40761e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  70.21 
 
 
143 aa  213  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.78919e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  68.57 
 
 
142 aa  212  2e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  68.35 
 
 
145 aa  209  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.16087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  67.86 
 
 
144 aa  209  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.46357e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  67.88 
 
 
142 aa  203  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  67.88 
 
 
142 aa  203  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 
143 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.56517e-13  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  66.91 
 
 
145 aa  201  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.18025e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  67.15 
 
 
144 aa  201  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.60952e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  65.96 
 
 
144 aa  200  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.19018e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  65.03 
 
 
145 aa  195  2e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  64.34 
 
 
145 aa  194  4e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.14694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  65.94 
 
 
148 aa  194  4e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 
147 aa  189  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  61.76 
 
 
143 aa  189  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.18039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 
145 aa  189  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.51399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  187  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  9.86136e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.75046e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  186  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  186  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.80183e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  186  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.45264e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  186  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.03793e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  186  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 
145 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.63354e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 
145 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.68177e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 
145 aa  184  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.49627e-09  hitchhiker  1.137e-08 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 
147 aa  184  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.58182e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  64.44 
 
 
150 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 
149 aa  184  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00491e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 
149 aa  184  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 
149 aa  183  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2364  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
144 aa  183  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.97609e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  62.22 
 
 
149 aa  183  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  61.43 
 
 
147 aa  183  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2679  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
144 aa  182  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.00743e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  182  1e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.52627e-09  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  181  2e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.33795e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 
149 aa  181  2e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  64.23 
 
 
142 aa  182  2e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.21803e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 
149 aa  181  2e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
142 aa  181  4e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.23224e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  62.22 
 
 
147 aa  180  5e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  58.82 
 
 
142 aa  180  5e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  62.77 
 
 
146 aa  180  5e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.19663e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  62.22 
 
 
147 aa  180  5e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
148 aa  180  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  8.3935e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  61.76 
 
 
150 aa  180  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
143 aa  179  9e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.97035e-08  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
148 aa  179  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  7.49109e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
143 aa  179  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.82384e-07  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
143 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.36521e-09  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  62.96 
 
 
142 aa  179  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 
149 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
147 aa  178  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  60 
 
 
149 aa  178  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 
147 aa  178  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
143 aa  178  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.49881e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
150 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
150 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  62.22 
 
 
147 aa  177  5e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
142 aa  177  6e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  60 
 
 
145 aa  176  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.19852e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
142 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.58843e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
149 aa  176  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
142 aa  176  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  1.37696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
151 aa  176  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.5141e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 
142 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.05135e-07  hitchhiker  3.559e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.80495e-06  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.18641e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
143 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.56575e-09  decreased coverage  1.94665e-06 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 
147 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 
150 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.45483e-07  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
142 aa  175  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 
147 aa  175  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.11952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  175  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.28707e-09  hitchhiker  9.18521e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.71958e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  58.57 
 
 
147 aa  174  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
147 aa  174  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  58.09 
 
 
142 aa  174  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
143 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.77368e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
151 aa  174  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 
144 aa  174  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60 
 
 
145 aa  173  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-05  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 
151 aa  174  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  56.2 
 
 
142 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 
148 aa  174  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  4.52598e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  173  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.92865e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  173  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 
142 aa  173  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.72076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  173  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.22799e-07  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  55 
 
 
142 aa  173  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.54571e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>