More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0251 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.92 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.01 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.51 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.35 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.53 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.13 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1210  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.15 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.59 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.01 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.97 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.79 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.7 
 
 		 275 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.56 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.6 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.59 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.8 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.15 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.41 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.7 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  42.91 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.47 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 		 294 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.59 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.11 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.08 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.02 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.41 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.48 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.6 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.93 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.88 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4892  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.89 
 
 		 280 aa  194  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.8 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.8 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.8 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.96 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14581  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.28 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.47 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.4 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.99 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.91 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  44 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32358  predicted protein  44.31 
 
 		 355 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.68 
 
 		 258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.76 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2130  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.08 
 
 		 259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.53 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.13 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.41 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.14 
 
 		 295 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.25 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.44411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  40.15 
 
 		 288 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.43 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1773  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.77 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.908281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.68 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.03 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.7 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.86 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.15 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17161  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.04 
 
 		 295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.64 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.02 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0490  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.57 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.71 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.54 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.77 
 
 		 301 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.94 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.64 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.64 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.37 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.8 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.91 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>