More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0236 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  70.56 
 
 
249 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  70.04 
 
 
249 aa  352  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  67.21 
 
 
248 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  65.99 
 
 
248 aa  341  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  65.32 
 
 
248 aa  338  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  62.1 
 
 
248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  60.48 
 
 
249 aa  318  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  62.1 
 
 
248 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  61.69 
 
 
248 aa  316  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  61.69 
 
 
248 aa  316  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  61.69 
 
 
248 aa  316  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  61.69 
 
 
248 aa  316  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  61.69 
 
 
248 aa  316  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  61.69 
 
 
248 aa  316  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  58.54 
 
 
249 aa  316  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  58.54 
 
 
249 aa  316  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  60.89 
 
 
248 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  61.29 
 
 
248 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  62.71 
 
 
236 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  62.71 
 
 
236 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  62.71 
 
 
236 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  57.83 
 
 
251 aa  301  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  58.47 
 
 
248 aa  301  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  57.72 
 
 
247 aa  298  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  60.08 
 
 
248 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  58.54 
 
 
255 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  58.47 
 
 
236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  56.47 
 
 
256 aa  287  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  53.63 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  57.55 
 
 
251 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  56.5 
 
 
257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  58.9 
 
 
236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  56.73 
 
 
251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  56.35 
 
 
254 aa  281  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  55.1 
 
 
251 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  55.65 
 
 
248 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  58.05 
 
 
236 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  58.9 
 
 
236 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  54.03 
 
 
268 aa  278  5e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  54.37 
 
 
281 aa  278  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  54.44 
 
 
248 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  52.44 
 
 
257 aa  276  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 
272 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  53.01 
 
 
272 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 
274 aa  275  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  55.47 
 
 
256 aa  274  8e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  53.91 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  53.41 
 
 
271 aa  272  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  54.03 
 
 
250 aa  272  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  54.07 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  55.28 
 
 
259 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  53.25 
 
 
259 aa  271  8.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 
249 aa  270  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  51.97 
 
 
257 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
254 aa  268  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  52.21 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  48.19 
 
 
266 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 
250 aa  263  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
254 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
249 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  52.23 
 
 
250 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  47.77 
 
 
249 aa  259  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
265 aa  258  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
272 aa  258  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
264 aa  258  9e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
250 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
262 aa  255  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  47.98 
 
 
270 aa  255  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  49.59 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  48.62 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  54.22 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
250 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  48.37 
 
 
249 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2753  methionine aminopeptidase, type I  53.41 
 
 
254 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
262 aa  251  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 
254 aa  250  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12113  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
277 aa  249  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0855577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  47.18 
 
 
248 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
274 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
263 aa  248  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  49.61 
 
 
261 aa  248  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  48.56 
 
 
251 aa  246  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  48.99 
 
 
277 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  48.19 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1830  peptidase M24A  47.27 
 
 
260 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  46.96 
 
 
262 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0310  methionine aminopeptidase, type I  49.22 
 
 
265 aa  241  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0001286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  48.19 
 
 
279 aa  241  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  48.18 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  47.37 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  54.32 
 
 
264 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>