More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0226 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 106 aa  213  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  71.43 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  70.75 
 
 		 106 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  63.21 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  65.38 
 
 		 107 aa  139  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  66.99 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  62.14 
 
 		 104 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  53.27 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  57.55 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  56.36 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  51.82 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  49 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  52.48 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  49 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  48.25 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3994  ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0409  ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 80 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 115 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>