More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0216 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  75.73 
 
 		 206 aa  315  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  68.6 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  68.12 
 
 		 207 aa  286  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  69.08 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  68.6 
 
 		 207 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  68.6 
 
 		 207 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  67.96 
 
 		 206 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  65.22 
 
 		 207 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  64.73 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  64.25 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  60.39 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  59.62 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  58.45 
 
 		 207 aa  250  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  59.22 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  57.28 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  59.42 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  58.17 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  56.8 
 
 		 204 aa  247  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  57.77 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  57.28 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  55.07 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  53.4 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  53.4 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  53.4 
 
 		 207 aa  222  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  53.62 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  51.22 
 
 		 223 aa  217  7.999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  52.17 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  53.37 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  50.96 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  52.91 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  51.58 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  49.76 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  51.49 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  47.06 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  49.76 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  48.53 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  50 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  47.75 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  47.52 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  49.07 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  49.07 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  49.28 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  47.34 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  49.56 
 
 		 235 aa  191  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  49.56 
 
 		 235 aa  191  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  45.32 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  45.93 
 
 		 215 aa  187  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 210 aa  186  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  50.52 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  48.08 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  46.86 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  50 
 
 		 223 aa  185  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  47.34 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  48.11 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  47.52 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  47.83 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  44.06 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  48.51 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  46.63 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  46.57 
 
 		 208 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>